RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479413.1

C9orf85-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf85, Length 902 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-205ENST00000479413 LINC00643Q86TS7 51 aa7.61□□□□□ -1.19
C9orf85-205ENST00000479413 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf85-205ENST00000479413 hADV29S1A0JD25 119 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf85-205ENST00000479413 SMIM29Q86T20 159 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf85-205ENST00000479413 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 A0A1B0GV72 72 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 A0A0G2JQZ4 141 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 CCKP06307 115 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 PDE6GP18545 87 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf85-205ENST00000479413 F8WEM9 126 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 Q6JHZ5 121 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 Q6ZQY7 126 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 Q6ZQT0 140 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 LINC00846Q9NV44 126 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
C9orf85-205ENST00000479413 DSCR8Q96T75 97 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 Q75L30 129 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 UBL5Q9BZL1 73 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 A0A1B0GW54 56 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 IGFL1Q6UW32 110 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf85-205ENST00000479413 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 ATOX1O00244 68 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 CXCL6P80162 114 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 Q96NJ1 140 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf85-205ENST00000479413 Q6ZVQ6 151 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 UQCRQO14949 82 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 COX7CP15954 63 aa7.29□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.29□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 CCDC179H3BU77 68 aa7.28□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.28□□□□□ -1.24
C9orf85-205ENST00000479413 SERP2Q8N6R1 65 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 A8MUU9 505 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 A0A087WVE0 104 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 NREPQ16612 68 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 USH2AO75445 5202 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf85-205ENST00000479413 A0A087WSZ3 146 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 A0A1W2PNM2 257 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 FAM236CP0DP71 79 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 LCE3BQ5TA77 95 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 DSCR10P59022 87 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 SSPOA2VEC9 5147 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 BPY2O14599 106 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 MT2AP02795 61 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf85-205ENST00000479413 IGKV4-1P06312 121 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 LINC00313P59037 77 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 MT1FP04733 61 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP10-10P60014 251 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 TMEM258P61165 79 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf85-205ENST00000479413 HRES1P13985 223 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KLKP1Q107X0 134 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 NDUFC1O43677 76 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 OCR1Q9BZK8 76 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 C20orf197Q8N268 126 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 Q8N9L7 120 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf85-205ENST00000479413 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 J3KT08 172 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 LINC00472Q9H8W2 130 aa7□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 HCG22E2RYF7 251 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 K7EQZ3 153 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 A8MWP4 228 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 C8orf87E5RJ46 101 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 H7BZZ5 65 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf85-205ENST00000479413 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf85-205ENST00000479413 PRR15Q8IV56 129 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms