RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PNM2 257 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 Q5XG85 94 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 ATOX1O00244 68 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 COX7CP15954 63 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 LIMD2Q9BT23 127 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-207ENST00000471650 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 CCKP06307 115 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 PDE6GP18545 87 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM258P61165 79 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZQT0 140 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR4Q16378 134 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WSZ3 146 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf195Q5TG92 126 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1B0GW54 56 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP1-207ENST00000471650 SERP2Q8N6R1 65 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1-207ENST00000471650 Q96NJ1 140 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 TPRXLQ17RH7 258 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 SSPOA2VEC9 5147 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV4-1P06312 121 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 NREPQ16612 68 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00846Q9NV44 126 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 USH2AO75445 5202 aa5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 LCE2CQ5TA81 110 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 C9orf92A6NGG3 77 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM236CP0DP71 79 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZVQ6 151 aa5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 UBL5Q9BZL1 73 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 PRO0628Q9UI54 55 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1B0GVX0 72 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 A8MWP4 228 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 BPY2O14599 106 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 XP32Q5T750 250 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1-207ENST00000471650 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFB1O75438 58 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 DSCR10P59022 87 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00313P59037 77 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 C4orf26Q17RF5 130 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 C8orf87E5RJ46 101 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFC1O43677 76 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 MT1HP80294 61 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR15Q8IV56 129 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A087WVE0 104 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 KLKP1Q107X0 134 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 K7EQZ3 153 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SH3BP1-207ENST00000471650 CXCL6P80162 114 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 Q75L30 129 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 C20orf197Q8N268 126 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.76□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 A8MUU9 505 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 H7BZZ5 65 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 Q8N9L7 120 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.74□□□□□ -1.49
SH3BP1-207ENST00000471650 hDV103S1A0JD37 113 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 PCOTHQ58A44 107 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 V9GYY9 64 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 HCG22E2RYF7 251 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 CASC2Q6XLA1 102 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SH3BP1-207ENST00000471650 NEBP20929 6669 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SEC61GP60059 68 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFS5O43920 106 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 BRK1Q8WUW1 75 aa5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 SNURFQ9Y675 71 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.7 ms