RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP10-10P60014 251 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1-204ENST00000459646 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MTURNQ8N3F0 131 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1-204ENST00000459646 DSCR8Q96T75 97 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1-204ENST00000459646 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MT2AP02795 61 aa4.27□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 HRES1P13985 223 aa4.27□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GVX0 72 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf87E5RJ46 101 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2V1Q13404 147 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 C9JAW5 83 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFB1O75438 58 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1FP04733 61 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK7P58062 85 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PYY3Q5JQD4 70 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 J3KT08 172 aa4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1-204ENST00000459646 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.2□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZQT0 140 aa4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.18□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00846Q9NV44 126 aa4.17□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 ATXN8Q156A1 80 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP1-204ENST00000459646 A8MWP4 228 aa4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFS5O43920 106 aa4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 NREPQ16612 68 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZVQ6 151 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R143 59 aa4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE6GP18545 87 aa4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GW54 56 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR15Q8IV56 129 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2-30P06310 120 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP1-204ENST00000459646 hDV103S1A0JD37 113 aa4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 BATFQ16520 125 aa4.08□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.07□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 TSTD3H0UI37 97 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EQZ3 153 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 NEBP20929 6669 aa4.05□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 BPY2O14599 106 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 Q5W150 140 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 HCG22E2RYF7 251 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 C4orf26Q17RF5 130 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 CASC2Q6XLA1 102 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8N9L7 120 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BT86 120 aa3.99□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf118A6NHY6 69 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf47Q569G3 176 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1W2PPM0 123 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM6P0DI80 62 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL6P80162 114 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 TAX1BP3O14907 124 aa3.94□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 S4R3F8 94 aa3.93□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 CSAG1Q6PB30 78 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 UBL5Q9BZL1 73 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 A6NN06 94 aa3.91□□□□□ -1.78
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 Q5VV11 94 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 LCA10Q71F78 164 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 IMUPQ9GZP8 106 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1BP07438 61 aa3.83□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 KLKP1Q107X0 134 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EP34 96 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PRO0461Q9UI25 63 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP10-5P60370 271 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087WVE0 104 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1-204ENST00000459646 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1-204ENST00000459646 ETDBQ3ZM63 59 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms