RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSCR8Q96T75 97 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0R2T5 61 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 K7EP34 96 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATXN8Q156A1 80 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.02□□□□□ -1.13
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9JAW5 83 aa8.02□□□□□ -1.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVX0 72 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.97□□□□□ -1.13
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE6GP18545 87 aa7.9□□□□□ -1.14
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A8MWP4 228 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HRES1P13985 223 aa7.85□□□□□ -1.15
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM236CP0DP71 79 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.84□□□□□ -1.15
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTURNQ8N3F0 131 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NREPQ16612 68 aa7.81□□□□□ -1.16
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPINK7P58062 85 aa7.76□□□□□ -1.17
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 K7EQZ3 153 aa7.71□□□□□ -1.18
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASC2Q6XLA1 102 aa7.55□□□□□ -1.2
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV2-30P06310 120 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACYP1P07311 99 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.5□□□□□ -1.21
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MT-ATP8P03928 68 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXCL6P80162 114 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEBP20929 6669 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IMUPQ9GZP8 106 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.28□□□□□ -1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C5orf47Q569G3 176 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 S4R3F8 94 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCA10Q71F78 164 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.18□□□□□ -1.26
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