RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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RABGEF1-204ENST00000442563 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GVX0 72 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf87E5RJ46 101 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EP34 96 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFB1O75438 58 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 NREPQ16612 68 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 PRO0461Q9UI25 63 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MWP4 228 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-204ENST00000442563 LCE2CQ5TA81 110 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-204ENST00000442563 F8W1H4 67 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR15Q8IV56 129 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-204ENST00000442563 BPY2O14599 106 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZVQ6 151 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 MT1HP80294 61 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EQZ3 153 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00846Q9NV44 126 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-204ENST00000442563 ETDBQ3ZM63 59 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-204ENST00000442563 UBL5Q9BZL1 73 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-204ENST00000442563 hDV103S1A0JD37 113 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HRES1P13985 223 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK7P58062 85 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8N9L7 120 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R2T5 61 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-204ENST00000442563 CASC2Q6XLA1 102 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFS5O43920 106 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 ACYP1P07311 99 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 CXCL6P80162 114 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM236CP0DP71 79 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 HCG22E2RYF7 251 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GV90 55 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 Q5W150 140 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-204ENST00000442563 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-204ENST00000442563 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2-30P06310 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00643Q86TS7 51 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 J3QR89 54 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-204ENST00000442563 C4orf26Q17RF5 130 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 MT2AP02795 61 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-204ENST00000442563 UQCRQO14949 82 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087WVE0 104 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MT1FP04733 61 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ATOX1O00244 68 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP10-10P60014 251 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 H0Y9P7 68 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OCR1Q9BZK8 76 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-204ENST00000442563 K7ERU9 68 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IMUPQ9GZP8 106 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 S4R3F8 94 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MP68P56378 58 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 C5orf47Q569G3 176 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00208Q96KT6 92 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 USH2AO75445 5202 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CSAG1Q6PB30 78 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SCGB1A1P11684 91 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LCA10Q71F78 164 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LCE2BO14633 110 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BPC8 53 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MT-ATP8P03928 68 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MUN3 132 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KLKP1Q107X0 134 aa7.84□□□□□ -1.15
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