RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 CCKP06307 115 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 IGKV4-1P06312 121 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 MTURNQ8N3F0 131 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 PRO0461Q9UI25 63 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 VPS25Q9BRG1 176 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 H3BQ85 93 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 UBE2V1Q13404 147 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 H3BT86 120 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 LINC00313P59037 77 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-209ENST00000439106 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PRAME-209ENST00000439106 F8W1H4 67 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-209ENST00000439106 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-209ENST00000439106 DSCR8Q96T75 97 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GVX0 72 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 ETDBQ3ZM63 59 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 C14orf132Q9NPU4 83 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZQT0 140 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 C8orf87E5RJ46 101 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 FAM236CP0DP71 79 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 HRES1P13985 223 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-209ENST00000439106 LCE2BO14633 110 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 J3KT08 172 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 PDE6GP18545 87 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 USH2AO75445 5202 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.91□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB1O75438 58 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-209ENST00000439106 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 SSPOA2VEC9 5147 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 A8MWP4 228 aa6.88□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 MT2AP02795 61 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 SPINK7P58062 85 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GW54 56 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-209ENST00000439106 NREPQ16612 68 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZVQ6 151 aa6.82□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 PRR15Q8IV56 129 aa6.82□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 MT1FP04733 61 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 LINC00846Q9NV44 126 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 J3QR89 54 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 K7EQZ3 153 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 ACYP1P07311 99 aa6.78□□□□□ -1.32
PRAME-209ENST00000439106 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 K7ERU9 68 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-10P60014 251 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 UBL5Q9BZL1 73 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 hDV103S1A0JD37 113 aa6.73□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 NDUFS5O43920 106 aa6.73□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 Q8N9L7 120 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-209ENST00000439106 BPY2O14599 106 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 Q5W150 140 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 LINC00643Q86TS7 51 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2-30P06310 120 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-209ENST00000439106 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 CXCL6P80162 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.64□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 CASC2Q6XLA1 102 aa6.63□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 HCG22E2RYF7 251 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.6□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.6□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.59□□□□□ -1.35
PRAME-209ENST00000439106 MT-ATP8P03928 68 aa6.58□□□□□ -1.36
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRAME-209ENST00000439106 C4orf26Q17RF5 130 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WVE0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-209ENST00000439106 IMUPQ9GZP8 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 C5orf47Q569G3 176 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-209ENST00000439106 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-209ENST00000439106 S4R3F8 94 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-209ENST00000439106 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-209ENST00000439106 LCA10Q71F78 164 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms