RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LIMD2Q9BT23 127 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV2D-28P01615 120 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf82Q6UX34 121 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRK1Q8WUW1 75 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM104AQ969W3 186 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H3BT86 120 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPC2P61916 151 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7ERJ3 54 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATOX1O00244 68 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXCL5P42830 114 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0J9YXY3 114 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIMM17BO60830 172 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCL1BO95988 128 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MT4P47944 62 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSCR8Q96T75 97 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0B4J2C4 111 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q5VV11 94 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C8orf87E5RJ46 101 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACYP1P07311 99 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LITAFQ99732 161 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 hADV29S1A0JD25 119 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0A0MQY5 61 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFS5O43920 106 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFTA2Q6UW10 78 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRSS2P07478 247 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERP2Q8N6R1 65 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMB2P49721 201 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00643Q86TS7 51 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COX6CP09669 75 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COX7B2Q8TF08 81 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q1RN00 199 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATXN8Q156A1 80 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q8IZM0 81 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H7C2G1 150 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIAP1O43715 76 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COX17Q14061 63 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q8NDZ9 215 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LST1O00453 97 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HRES1P13985 223 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00158P58513 81 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LCA10Q71F78 164 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRYO14603 147 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFC1O43677 76 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCKP06307 115 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q6ZVQ6 151 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A8MUN3 132 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H0YGX0 51 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLEC2BQ92478 149 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM29Q86T20 159 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MP68P56378 58 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H7BZZ5 65 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXCL6P80162 114 aa3.72□□□□□ -1.81
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