RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf195Q5TG92 126 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 LIMD2Q9BT23 127 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A0U1RQV1 116 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPG2P98160 4391 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 SPINK1P00995 79 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM229AH3BQW9 127 aa12.33□□□□□ -0.44
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SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf47Q569G3 176 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM258P61165 79 aa12.29□□□□□ -0.44
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SH3BP5-204ENST00000412806 FAM236CP0DP71 79 aa12.15□□□□□ -0.46
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SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf64Q8NEQ6 169 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa12.01□□□□□ -0.49
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SH3BP5-204ENST00000412806 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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SH3BP5-204ENST00000412806 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
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SH3BP5-204ENST00000412806 COX6B2Q6YFQ2 88 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP5-204ENST00000412806 PRR15LQ9BU68 103 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-204ENST00000412806 Q5VV11 94 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP5-204ENST00000412806 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP5-204ENST00000412806 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.94□□□□□ -0.66
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SH3BP5-204ENST00000412806 BRK1Q8WUW1 75 aa10.9□□□□□ -0.66
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