RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 A0A087WSZ3 146 aa8.84□□□□□ -0.99
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PXDC1-201ENST00000380277 H7BZZ5 65 aa8.82□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.82□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.81□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 A0A0G2JQZ4 141 aa8.81□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 K7EQZ3 153 aa8.81□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00483Q53H64 154 aa8.81□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.81□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 A0A087X002 238 aa8.8□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.8□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 FAM236CP0DP71 79 aa8.8□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 HCG22E2RYF7 251 aa8.8□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 SNURFQ9Y675 71 aa8.8□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.79□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PXDC1-201ENST00000380277 A0A0U1RQV1 116 aa8.77□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.75□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.75□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.74□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 A8MWP4 228 aa8.73□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.72□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 C5orf47Q569G3 176 aa8.72□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 PRR15Q8IV56 129 aa8.72□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.72□□□□□ -1.01
PXDC1-201ENST00000380277 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.7□□□□□ -1.02
PXDC1-201ENST00000380277 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PXDC1-201ENST00000380277 NDUFB1O75438 58 aa8.67□□□□□ -1.02
PXDC1-201ENST00000380277 CASC2Q6XLA1 102 aa8.66□□□□□ -1.02
PXDC1-201ENST00000380277 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.66□□□□□ -1.02
PXDC1-201ENST00000380277 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 MOBPQ13875 183 aa8.64□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.64□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 H3BPC8 53 aa8.62□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 MP68P56378 58 aa8.62□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 Q96NJ1 140 aa8.62□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.59□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 CD164Q04900 197 aa8.59□□□□□ -1.03
PXDC1-201ENST00000380277 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.57□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.57□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 LRP2P98164 4655 aa8.56□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.56□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.56□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 hDV103S1A0JD37 113 aa8.55□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.55□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.55□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.54□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 A0A1B0GVX0 72 aa8.54□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 H0Y9P7 68 aa8.54□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.54□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.54□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.53□□□□□ -1.04
PXDC1-201ENST00000380277 LPAP08519 4548 aa8.51□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 SPINK1P00995 79 aa8.51□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 PRR4Q16378 134 aa8.51□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00208Q96KT6 92 aa8.51□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.5□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 Q5XG85 94 aa8.5□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.49□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.49□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.47□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 SVIPQ8NHG7 77 aa8.47□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.46□□□□□ -1.05
PXDC1-201ENST00000380277 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.45□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 C8orf87E5RJ46 101 aa8.42□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 C4orf26Q17RF5 130 aa8.42□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PXDC1-201ENST00000380277 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 NDUFS5O43920 106 aa8.38□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 LIMD2Q9BT23 127 aa8.38□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.37□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 TPRXLQ17RH7 258 aa8.34□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.34□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 RNF213Q63HN8 5207 aa8.34□□□□□ -1.07
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.34□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 C1orf195Q5TG92 126 aa8.31□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.3□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00313P59037 77 aa8.29□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 Q1T7F1 81 aa8.29□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.28□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.28□□□□□ -1.08
PXDC1-201ENST00000380277 XP32Q5T750 250 aa8.26□□□□□ -1.09
PXDC1-201ENST00000380277 V9GYY9 64 aa8.26□□□□□ -1.09
PXDC1-201ENST00000380277 PCOTHQ58A44 107 aa8.24□□□□□ -1.09
PXDC1-201ENST00000380277 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PXDC1-201ENST00000380277 MUC17Q685J3 4493 aa8.22□□□□□ -1.09
PXDC1-201ENST00000380277 Q5W150 140 aa8.21□□□□□ -1.1
PXDC1-201ENST00000380277 MUC2Q02817 5179 aa8.21□□□□□ -1.1
PXDC1-201ENST00000380277 COA5Q86WW8 74 aa8.19□□□□□ -1.1
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.18□□□□□ -1.1
PXDC1-201ENST00000380277 C9orf92A6NGG3 77 aa8.13□□□□□ -1.11
PXDC1-201ENST00000380277 PRO0628Q9UI54 55 aa8.13□□□□□ -1.11
PXDC1-201ENST00000380277 IGKV2-30P06310 120 aa8.11□□□□□ -1.11
PXDC1-201ENST00000380277 HRES1P13985 223 aa8.08□□□□□ -1.12
PXDC1-201ENST00000380277 ACYP2P14621 99 aa8.07□□□□□ -1.12
PXDC1-201ENST00000380277 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PXDC1-201ENST00000380277 BRK1Q8WUW1 75 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms