RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 TENM4Q6N022 2769 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 FBN2P35556 2912 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 NF1P21359 2839 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-201ENST00000345716 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.94□□□□□ -0.5
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NISCH-201ENST00000345716 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
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NISCH-201ENST00000345716 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.06□□□□□ -0.64
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NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GVY2 172 aa10.81□□□□□ -0.68
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NISCH-201ENST00000345716 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP10-8P60410 259 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-201ENST00000345716 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-201ENST00000345716 TNP1P09430 55 aa10.65□□□□□ -0.7
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NISCH-201ENST00000345716 BSNQ9UPA5 3926 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-201ENST00000345716 P0C880 135 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-201ENST00000345716 C10orf95Q9H7T3 257 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-201ENST00000345716 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.5□□□□□ -0.73
NISCH-201ENST00000345716 NDUFAF8A1L188 74 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-201ENST00000345716 FBN3Q75N90 2809 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-201ENST00000345716 PP632Q6XCG6 107 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-201ENST00000345716 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP10-10P60014 251 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-201ENST00000345716 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.28□□□□□ -0.76
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.26□□□□□ -0.77
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NISCH-201ENST00000345716 VPS13CQ709C8 3753 aa10.07□□□□□ -0.8
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NISCH-201ENST00000345716 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-201ENST00000345716 AKAP9Q99996 3911 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-201ENST00000345716 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-201ENST00000345716 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-201ENST00000345716 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-201ENST00000345716 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-201ENST00000345716 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
NISCH-201ENST00000345716 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.4□□□□□ -0.9
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