RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZR54 194 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRU-201ENST00000345512 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00483Q53H64 154 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 A0A087X002 238 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 LCA10Q71F78 164 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 Q8N1X5 172 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 A8MU10 97 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 Q5W150 140 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 ZFHX3Q15911 3703 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf92A6NGG3 77 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRU-201ENST00000345512 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRU-201ENST00000345512 PRAC1Q96KF2 57 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRU-201ENST00000345512 DMAC1Q96GE9 116 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-2P60368 255 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRU-201ENST00000345512 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRU-201ENST00000345512 A6NN06 94 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-1P60331 282 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRU-201ENST00000345512 TENM2Q9NT68 2774 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRU-201ENST00000345512 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRU-201ENST00000345512 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01554Q52M75 96 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1B0GU33 70 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRU-201ENST00000345512 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRU-201ENST00000345512 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRU-201ENST00000345512 TGP01266 2768 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 CSAG1Q6PB30 78 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0D9SG42 100 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRU-201ENST00000345512 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-201ENST00000345512 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.8□□□□□ -1
PTPRU-201ENST00000345512 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRU-201ENST00000345512 CRIPTQ9P021 101 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRU-201ENST00000345512 AKAP9Q99996 3911 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRU-201ENST00000345512 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRU-201ENST00000345512 FBN3Q75N90 2809 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRU-201ENST00000345512 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRU-201ENST00000345512 H3BS24 57 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZSA8 131 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 S4R3F8 94 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRU-201ENST00000345512 COL7A1Q02388 2944 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRU-201ENST00000345512 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-201ENST00000345512 ROMO1P60602 79 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-201ENST00000345512 A8MUU9 505 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-201ENST00000345512 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRU-201ENST00000345512 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRU-201ENST00000345512 Q5VSD8 79 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRU-201ENST00000345512 H0YAA0 97 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRU-201ENST00000345512 J3QL48 77 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRU-201ENST00000345512 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRU-201ENST00000345512 R4GN34 69 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRU-201ENST00000345512 M0QZ58 72 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRU-201ENST00000345512 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 XP32Q5T750 250 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 LUZP6Q538Z0 58 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRU-201ENST00000345512 P0C880 135 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFAF8A1L188 74 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRU-201ENST00000345512 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1B0GVY2 172 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-8P60410 259 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRU-201ENST00000345512 ANK2Q01484 3957 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP12-2P59991 146 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 M0R2T5 61 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 TPRXLQ17RH7 258 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRU-201ENST00000345512 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0A0MQY5 61 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP12-1P59990 96 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRU-201ENST00000345512 LYSTQ99698 3801 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRU-201ENST00000345512 PLAC4Q8WY50 150 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.8 ms