RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 C1orf195Q5TG92 126 aa10.27□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 TMEM258P61165 79 aa10.27□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.27□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 C5orf47Q569G3 176 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 FAT1Q14517 4588 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 LIMD2Q9BT23 127 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 SPINK1P00995 79 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTB-201ENST00000331789 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 NDUFC1O43677 76 aa10.19□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 FAM229AH3BQW9 127 aa10.18□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 H0Y9P7 68 aa10.17□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 NDUFS5O43920 106 aa10.17□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 MP68P56378 58 aa10.17□□□□□ -0.78
ACTB-201ENST00000331789 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.15□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 C8orf87E5RJ46 101 aa10.15□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 FAM236CP0DP71 79 aa10.15□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 LINC00208Q96KT6 92 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 LINC00313P59037 77 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 Q5VSD8 79 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-201ENST00000331789 H3BPC8 53 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTB-201ENST00000331789 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTB-201ENST00000331789 HSPG2P98160 4391 aa10.06□□□□□ -0.8
ACTB-201ENST00000331789 RYR1P21817 5038 aa10.05□□□□□ -0.8
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTB-201ENST00000331789 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 Q5W150 140 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 OXTP01178 125 aa10□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 Q8N1X5 172 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.97□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-8P60410 259 aa9.96□□□□□ -0.81
ACTB-201ENST00000331789 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 PRR4Q16378 134 aa9.95□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.94□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 PCOTHQ58A44 107 aa9.93□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ACTB-201ENST00000331789 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.88□□□□□ -0.83
ACTB-201ENST00000331789 C9orf92A6NGG3 77 aa9.87□□□□□ -0.83
ACTB-201ENST00000331789 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-201ENST00000331789 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-201ENST00000331789 TNXBP22105 4242 aa9.86□□□□□ -0.83
ACTB-201ENST00000331789 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.82□□□□□ -0.84
ACTB-201ENST00000331789 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2-30P06310 120 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-201ENST00000331789 MT1HL1P0DM35 61 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTB-201ENST00000331789 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 A8MUU9 505 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.72□□□□□ -0.85
ACTB-201ENST00000331789 HRES1P13985 223 aa9.7□□□□□ -0.86
ACTB-201ENST00000331789 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
ACTB-201ENST00000331789 MYCBP2O75592 4640 aa9.67□□□□□ -0.86
ACTB-201ENST00000331789 COA5Q86WW8 74 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-201ENST00000331789 C4orf26Q17RF5 130 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-201ENST00000331789 Q75L30 129 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-201ENST00000331789 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-201ENST00000331789 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-201ENST00000331789 DMAC1Q96GE9 116 aa9.56□□□□□ -0.88
ACTB-201ENST00000331789 ACYP2P14621 99 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-201ENST00000331789 XP32Q5T750 250 aa9.52□□□□□ -0.88
ACTB-201ENST00000331789 SPINK7P58062 85 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-201ENST00000331789 Q1T7F1 81 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTB-201ENST00000331789 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTB-201ENST00000331789 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-201ENST00000331789 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-201ENST00000331789 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-201ENST00000331789 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.4□□□□□ -0.9
ACTB-201ENST00000331789 PSPHP1O15172 72 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 V9GYY9 64 aa9.39□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 HERC2O95714 4834 aa9.37□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 J3QL48 77 aa9.37□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 TPRXLQ17RH7 258 aa9.37□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 A8MUN3 132 aa9.35□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.35□□□□□ -0.91
ACTB-201ENST00000331789 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-201ENST00000331789 PRR15LQ9BU68 103 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-201ENST00000331789 Q5VV11 94 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-201ENST00000331789 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-201ENST00000331789 LPAP08519 4548 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-201ENST00000331789 LRP2P98164 4655 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTB-201ENST00000331789 BRK1Q8WUW1 75 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GU69 56 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTB-201ENST00000331789 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.09□□□□□ -0.95
ACTB-201ENST00000331789 SVIPQ8NHG7 77 aa9.08□□□□□ -0.96
ACTB-201ENST00000331789 A6NED7 52 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-201ENST00000331789 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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