RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.56□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 Q96NJ1 140 aa7.56□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.55□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 C9orf92A6NGG3 77 aa7.55□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.55□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.54□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.54□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.53□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2-30P06310 120 aa7.53□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 C1orf195Q5TG92 126 aa7.53□□□□□ -1.2
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 CD164Q04900 197 aa7.52□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.52□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.52□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 SPINK1P00995 79 aa7.51□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.5□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 PKHD1P08F94 4074 aa7.49□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.49□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 FAT1Q14517 4588 aa7.47□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 C8orf87E5RJ46 101 aa7.47□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 Q5VSD8 79 aa7.46□□□□□ -1.21
HPS1-201ENST00000325103 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.45□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 A0A1B0GVY2 172 aa7.43□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.43□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.43□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 OXTP01178 125 aa7.42□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.42□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 C4orf26Q17RF5 130 aa7.42□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 H3BPC8 53 aa7.41□□□□□ -1.22
HPS1-201ENST00000325103 Q5W150 140 aa7.4□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 PKD1P98161 4303 aa7.38□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 PSPHP1O15172 72 aa7.38□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.38□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.36□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 RYR2Q92736 4967 aa7.36□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HPS1-201ENST00000325103 COA5Q86WW8 74 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS1-201ENST00000325103 BRK1Q8WUW1 75 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS1-201ENST00000325103 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS1-201ENST00000325103 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS1-201ENST00000325103 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.28□□□□□ -1.24
HPS1-201ENST00000325103 HRES1P13985 223 aa7.27□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 Q8N1X5 172 aa7.26□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 PRR15LQ9BU68 103 aa7.26□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 SVIPQ8NHG7 77 aa7.26□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 RYR3Q15413 4870 aa7.26□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 Q5XG85 94 aa7.25□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.24□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.24□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.23□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 ACYP2P14621 99 aa7.23□□□□□ -1.25
HPS1-201ENST00000325103 A8MUN3 132 aa7.21□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.21□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 J3QL48 77 aa7.18□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 A6NED7 52 aa7.16□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 V9GYY9 64 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-201ENST00000325103 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.14□□□□□ -1.27
HPS1-201ENST00000325103 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HPS1-201ENST00000325103 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-201ENST00000325103 SPINK7P58062 85 aa7.11□□□□□ -1.27
HPS1-201ENST00000325103 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 SEC61GP60059 68 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 MYCBP2O75592 4640 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 A0A1B0GU69 56 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP10-8P60410 259 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 RYR1P21817 5038 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-201ENST00000325103 Q1T7F1 81 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 HSPG2P98160 4391 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 DMAC1Q96GE9 116 aa7.01□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 A8MUU9 505 aa6.99□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.98□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.98□□□□□ -1.29
HPS1-201ENST00000325103 Q5VV11 94 aa6.94□□□□□ -1.3
HPS1-201ENST00000325103 Q75L30 129 aa6.94□□□□□ -1.3
HPS1-201ENST00000325103 PRO0628Q9UI54 55 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-201ENST00000325103 XP32Q5T750 250 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-201ENST00000325103 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-201ENST00000325103 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.9□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 MT1HL1P0DM35 61 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 A8MU10 97 aa6.88□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 PMAIP1Q13794 54 aa6.87□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.84□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.84□□□□□ -1.31
HPS1-201ENST00000325103 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.8□□□□□ -1.32
HPS1-201ENST00000325103 UQCR11O14957 56 aa6.79□□□□□ -1.32
HPS1-201ENST00000325103 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.76□□□□□ -1.33
HPS1-201ENST00000325103 S4R3F8 94 aa6.74□□□□□ -1.33
HPS1-201ENST00000325103 HERC2O95714 4834 aa6.74□□□□□ -1.33
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