RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.8□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.8□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 COL6A3P12111 3177 aa6.8□□□□□ -1.32
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6ZR54 194 aa6.78□□□□□ -1.32
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HDGFL3-201ENST00000299633 USP34Q70CQ2 3546 aa6.75□□□□□ -1.33
HDGFL3-201ENST00000299633 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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HDGFL3-201ENST00000299633 A8MU10 97 aa6.73□□□□□ -1.33
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HDGFL3-201ENST00000299633 SZT2Q5T011 3432 aa6.68□□□□□ -1.34
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.67□□□□□ -1.34
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HDGFL3-201ENST00000299633 PP632Q6XCG6 107 aa6.56□□□□□ -1.36
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRR1BP22528 89 aa6.56□□□□□ -1.36
HDGFL3-201ENST00000299633 TNP1P09430 55 aa6.56□□□□□ -1.36
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HDGFL3-201ENST00000299633 P0C880 135 aa6.46□□□□□ -1.38
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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HDGFL3-201ENST00000299633 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.37□□□□□ -1.39
HDGFL3-201ENST00000299633 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.34□□□□□ -1.39
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HDGFL3-201ENST00000299633 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.33□□□□□ -1.4
HDGFL3-201ENST00000299633 LAMA5O15230 3695 aa6.3□□□□□ -1.4
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP10-2P60368 255 aa6.28□□□□□ -1.4
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.26□□□□□ -1.41
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP10-1P60331 282 aa6.26□□□□□ -1.41
HDGFL3-201ENST00000299633 BSNQ9UPA5 3926 aa6.25□□□□□ -1.41
HDGFL3-201ENST00000299633 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.23□□□□□ -1.41
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HDGFL3-201ENST00000299633 DMDP11532 3685 aa6.17□□□□□ -1.42
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP10-8P60410 259 aa6.16□□□□□ -1.42
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HDGFL3-201ENST00000299633 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.08□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 VPS13CQ709C8 3753 aa6.08□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.07□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 LYSTQ99698 3801 aa6.05□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.05□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.04□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 RELNP78509 3460 aa6.03□□□□□ -1.44
HDGFL3-201ENST00000299633 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.02□□□□□ -1.45
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.99□□□□□ -1.45
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.96□□□□□ -1.45
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.91□□□□□ -1.46
HDGFL3-201ENST00000299633 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.88□□□□□ -1.47
HDGFL3-201ENST00000299633 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.87□□□□□ -1.47
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP12-2P59991 146 aa5.86□□□□□ -1.47
HDGFL3-201ENST00000299633 FBN3Q75N90 2809 aa5.82□□□□□ -1.48
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.64□□□□□ -1.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.58□□□□□ -1.52
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC3AQ02505 3323 aa5.56□□□□□ -1.52
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAH2Q9P225 4427 aa5.52□□□□□ -1.53
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.51□□□□□ -1.53
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP12-1P59990 96 aa5.5□□□□□ -1.53
HDGFL3-201ENST00000299633 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.47□□□□□ -1.53
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.47□□□□□ -1.53
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
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