RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 S4R3F8 94 aa7.11□□□□□ -1.27
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CRIPTQ9P021 101 aa7.1□□□□□ -1.27
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.1□□□□□ -1.27
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.08□□□□□ -1.28
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.06□□□□□ -1.28
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GU33 70 aa7.05□□□□□ -1.28
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.04□□□□□ -1.28
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.03□□□□□ -1.28
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q75L30 129 aa7.03□□□□□ -1.28
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 H3BS24 57 aa7.01□□□□□ -1.29
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TENM2Q9NT68 2774 aa7□□□□□ -1.29
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.97□□□□□ -1.29
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 DMAC1Q96GE9 116 aa6.92□□□□□ -1.3
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 RELNP78509 3460 aa6.9□□□□□ -1.3
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 M0QZ58 72 aa6.83□□□□□ -1.32
ZKSCAN3-201ENST00000252211 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.82□□□□□ -1.32
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC3AQ02505 3323 aa6.78□□□□□ -1.32
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.78□□□□□ -1.32
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.76□□□□□ -1.33
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A6NN06 94 aa6.73□□□□□ -1.33
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLAC4Q8WY50 150 aa6.72□□□□□ -1.33
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A8MUU9 505 aa6.72□□□□□ -1.33
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A8MU10 97 aa6.71□□□□□ -1.33
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.71□□□□□ -1.34
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.69□□□□□ -1.34
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DMDP11532 3685 aa6.66□□□□□ -1.34
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GVY2 172 aa6.64□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 XP32Q5T750 250 aa6.63□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LUZP6Q538Z0 58 aa6.62□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.61□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TPRXLQ17RH7 258 aa6.61□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.61□□□□□ -1.35
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.58□□□□□ -1.36
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ROMO1P60602 79 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.48□□□□□ -1.37
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.46□□□□□ -1.38
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.39□□□□□ -1.39
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FBN3Q75N90 2809 aa6.39□□□□□ -1.39
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.34□□□□□ -1.39
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.32□□□□□ -1.4
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-10P60014 251 aa6.3□□□□□ -1.4
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TNP1P09430 55 aa6.28□□□□□ -1.4
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A0A0MQY5 61 aa6.28□□□□□ -1.4
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BSNQ9UPA5 3926 aa6.27□□□□□ -1.41
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFAF8A1L188 74 aa6.23□□□□□ -1.41
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.22□□□□□ -1.41
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.2□□□□□ -1.42
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COL7A1Q02388 2944 aa6.2□□□□□ -1.42
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.11□□□□□ -1.43
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.11□□□□□ -1.43
ZKSCAN3-201ENST00000252211 P0C880 135 aa6.1□□□□□ -1.43
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MT1HL1P0DM35 61 aa6.05□□□□□ -1.44
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CUBNO60494 3623 aa6.05□□□□□ -1.44
ZKSCAN3-201ENST00000252211 H0YAA0 97 aa6.04□□□□□ -1.44
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PP632Q6XCG6 107 aa6.03□□□□□ -1.44
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.95□□□□□ -1.46
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.92□□□□□ -1.46
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.87□□□□□ -1.47
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VPS13CQ709C8 3753 aa5.81□□□□□ -1.48
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNHD1Q96M86 4753 aa5.76□□□□□ -1.49
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP12-2P59991 146 aa5.73□□□□□ -1.49
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP12-1P59990 96 aa5.69□□□□□ -1.5
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.68□□□□□ -1.5
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.67□□□□□ -1.5
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.67□□□□□ -1.5
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AKAP9Q99996 3911 aa5.63□□□□□ -1.51
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.63□□□□□ -1.51
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.52□□□□□ -1.53
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.51□□□□□ -1.53
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.47□□□□□ -1.53
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