RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635754.1

CLN6-211, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

Gene CLN6, Length 1,441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-211ENST00000635754 K7ERJ3 54 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 Q6ZQY7 126 aa8.96□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 TSTD3H0UI37 97 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 SNCGO76070 127 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 Q8N377 158 aa8.93□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 M0R143 59 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 TRIAP1O43715 76 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 SPINK1P00995 79 aa8.92□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 PSMB2P49721 201 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 PRR4Q16378 134 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 SMIM29Q86T20 159 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.91□□□□□ -0.98
CLN6-211ENST00000635754 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.89□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 F8WEM9 126 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 COX6CP09669 75 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 A0A1B0GX51 115 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.88□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 CLEC2BQ92478 149 aa8.85□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.84□□□□□ -0.99
CLN6-211ENST00000635754 DNAL4O96015 105 aa8.82□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 CD164Q04900 197 aa8.82□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.82□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 LIMD2Q9BT23 127 aa8.81□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.8□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.8□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 Q6JHZ5 121 aa8.8□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 A0A0G2JQZ4 141 aa8.79□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 BATFQ16520 125 aa8.79□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.78□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.78□□□□□ -1
CLN6-211ENST00000635754 FABP2P12104 132 aa8.77□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 H3BQ85 93 aa8.76□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 LST1O00453 97 aa8.75□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 TRACP01848 142 aa8.75□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 IGFL1Q6UW32 110 aa8.75□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 LRP2P98164 4655 aa8.75□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 H3BUT2 72 aa8.74□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 TPRXLQ17RH7 258 aa8.73□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.72□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 H3BMG7 143 aa8.71□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.71□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 Q5XG85 94 aa8.71□□□□□ -1.01
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.71□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 LPAP08519 4548 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 TCL1BO95988 128 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 ATXN8Q156A1 80 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 CDIP1Q9H305 208 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 UBE2V1Q13404 147 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 TEN1Q86WV5 123 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN6-211ENST00000635754 A0A1B0GV72 72 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 C9orf118A6NHY6 69 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 TAX1BP3O14907 124 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 Q6Q795 121 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 C1orf195Q5TG92 126 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 A0A1W2PPM0 123 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN6-211ENST00000635754 A0A1W2PNM2 257 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 A0A087WSZ3 146 aa8.57□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 C9JAW5 83 aa8.56□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 DSCR8Q96T75 97 aa8.56□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.55□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 CCKP06307 115 aa8.55□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.54□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.54□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 C9orf92A6NGG3 77 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN6-211ENST00000635754 VPS25Q9BRG1 176 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 H3BT86 120 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 MTURNQ8N3F0 131 aa8.46□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 Q96NJ1 140 aa8.46□□□□□ -1.05
CLN6-211ENST00000635754 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.46□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 PDE6GP18545 87 aa8.46□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.46□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 Q6ZQT0 140 aa8.45□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.45□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.44□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.44□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 SIGMAR1Q99720 223 aa8.43□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 K7EP34 96 aa8.41□□□□□ -1.06
CLN6-211ENST00000635754 A0A1B0GW54 56 aa8.4□□□□□ -1.06
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