RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM236CP0DP71 79 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.49□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2D-28P01615 120 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01545Q5VT33 79 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 TNXBP22105 4242 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 C3orf79P0CE67 100 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GW54 56 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 AKR1D1P51857 326 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8NDZ9 215 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM126AQ9H061 195 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYGAP11844 174 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTDAPP60985 99 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 C20orf202A1L168 122 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TSTD3H0UI37 97 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 LST1O00453 97 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFC2O95298 119 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 DAND5Q8N907 189 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MWP4 228 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 NCR3O14931 201 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM17BO60830 172 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR1AP35321 89 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 PRLHP81277 87 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF815PA8K554 130 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MUN3 132 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV6-57P01721 117 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 NPC2P61916 151 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SCGB1A1P11684 91 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 COPS9Q8WXC6 57 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXCQ9NY87 97 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 IFITM1P13164 125 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ATOH7Q8N100 152 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR4Q96PI1 79 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MUU9 505 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A20O43772 301 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZRX8 168 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NED7 52 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ERC2-IT1O76042 136 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-5P60370 271 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 Q9BRP9 147 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BQ85 93 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00483Q53H64 154 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 COX7BP24311 80 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6Q795 121 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 DLEU1O43261 78 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINK1P00995 79 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0B4J2C4 111 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 COX8AP10176 69 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR1BP22528 89 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N9L7 120 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 IMUPQ9GZP8 106 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 MOBPQ13875 183 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 C14orf144Q96I85 54 aa4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms