RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 H0Y9J4 135 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 UQCRQO14949 82 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GX51 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC2BQ92478 149 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00167Q96N53 147 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF861PO60384 105 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RRA0 63 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 BCE1O60756 84 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00158P58513 81 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 COX17Q14061 63 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRM-214ENST00000583153 LRP2P98164 4655 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 CRYGAP11844 174 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 COX7CP15954 63 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2AP49459 152 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV2D-28P01615 120 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 ATOX1O00244 68 aa5□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf153Q5TBE3 101 aa5□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 H0YGX0 51 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 VPREB1P12018 145 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 J3KT08 172 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 Q6JHZ5 121 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 NPC2P61916 151 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf47Q569G3 176 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRM-214ENST00000583153 PRLHP81277 87 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 M0R378 163 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 SERP2Q8N6R1 65 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 Q8NDZ9 215 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087X002 238 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 NCR3O14931 201 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM258P61165 79 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 RNF213Q63HN8 5207 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 PRR4Q16378 134 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 PRYO14603 147 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 DNAL4O96015 105 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 CCKP06307 115 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 LPAP08519 4548 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRM-214ENST00000583153 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 hADV29S1A0JD25 119 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFC2O95298 119 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00846Q9NV44 126 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR1AP35321 89 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 SPRR4Q96PI1 79 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 H3BQ85 93 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-214ENST00000583153 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV6-57P01721 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 Q5XG85 94 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WVE0 104 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms