RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572433.5

ITGAE-208, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 731 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-208ENST00000572433 NPYP01303 97 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 TCRAP04437 139 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 EPDR1Q9UM22 224 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 H3BT86 120 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 TRACP01848 142 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 CRPP02741 224 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 C3orf79P0CE67 100 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 COX8AP10176 69 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 GCHFRP30047 84 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 UBE2G1P62253 170 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 IL36BQ9NZH7 164 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 A0A1B0GW54 56 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 MANBALQ9NQG1 85 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 HIGD1BQ9P298 99 aa3.35□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 TCL1BO95988 128 aa3.34□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.34□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 HAMPP81172 84 aa3.34□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.34□□□□□ -1.87
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 H3BVH4 76 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 M0R378 163 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 IGKCP01834 107 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ZNF56Q15929 161 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 C5orf38Q86SI9 138 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.33□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ATOX1O00244 68 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 COX7A2LO14548 114 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 NPC2P61916 151 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 MIAQ16674 131 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 Q6ZSA8 131 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 Q86TA4 180 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 BRK1Q8WUW1 75 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 SMIM13P0DJ93 91 aa3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 KRTAP12-4P60329 112 aa3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 DSCR8Q96T75 97 aa3.31□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 A8MUN3 132 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 LST1O00453 97 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 KRTDAPP60985 99 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 UBE2D3P61077 147 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 UBE2D2P62837 147 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 LCA10Q71F78 164 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 BAGE2Q86Y30 109 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TOMM6Q96B49 74 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.3□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 A0A0G2JQZ4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 CRIP1P50238 77 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 SERP2Q8N6R1 65 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 RNF213Q63HN8 5207 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 F2Z2F3 143 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 BCE1O60756 84 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ACYP1P07311 99 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 ENHOQ6UWT2 76 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGAE-208ENST00000572433 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 hADV29S1A0JD25 119 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 MGPP08493 103 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 KRTAP12-1P59990 96 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.27□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 HBBP68871 147 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 Q8N8P6 123 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 TSKUQ8WUA8 353 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 DIRC1Q969H9 104 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 PCOTHQ58A44 107 aa3.25□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.25□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 LINC00643Q86TS7 51 aa3.25□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.25□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.24□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 M0QY20 66 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms