RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568936.1

CCNDBP1-214, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZSA8 131 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 ATOX1O00244 68 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q8N377 158 aa7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZVQ6 151 aa7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 SCXQ7RTU7 201 aa7.16□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.15□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 RYR3Q15413 4870 aa7.15□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.15□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.15□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.15□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A087WVE0 104 aa7.14□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 BCE1O60756 84 aa7.13□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.13□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.13□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 CXCL6P80162 114 aa7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 UQCRQO14949 82 aa7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 H0Y9J4 135 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1B0GW54 56 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 COX7CP15954 63 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 UBE2AP49459 152 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 C1orf137Q5JT78 98 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-214ENST00000568936 SMIM29Q86T20 159 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 SERP2Q8N6R1 65 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 NREPQ16612 68 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1W2PNM2 257 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q8NBF4 154 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 F8WEM9 126 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF861PO60384 105 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGLV7-43P04211 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 CRYGAP11844 174 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 SPRR4Q96PI1 79 aa7.03□□□□□ -1.28
CCNDBP1-214ENST00000568936 SPRR1BP22528 89 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A0G2JQZ4 141 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 BPY2O14599 106 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 SMIM20Q8N5G0 67 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGKV4-1P06312 121 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC00483Q53H64 154 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGFL1Q6UW32 110 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q8N9L7 120 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAT1Q14517 4588 aa6.94□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM258P61165 79 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-214ENST00000568936 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 DSCR10P59022 87 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 C20orf197Q8N268 126 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A087WSZ3 146 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A087X002 238 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 HSPG2P98160 4391 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 MOBPQ13875 183 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 KLKP1Q107X0 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 K7EQZ3 153 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 OCR1Q9BZK8 76 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-214ENST00000568936 RYR1P21817 5038 aa6.84□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 CDK2AP2O75956 126 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 HCG22E2RYF7 251 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 H7BZZ5 65 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 SNURFQ9Y675 71 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 NDUFC1O43677 76 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 J3KT08 172 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-214ENST00000568936 A8MWP4 228 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q5VSD8 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A0U1RQV1 116 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM236CP0DP71 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRR15Q8IV56 129 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms