RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 KLKP1Q107X0 134 aa5.29□□□□□ -1.56
PDPR-210ENST00000568530 PRR34Q9NV39 138 aa5.29□□□□□ -1.56
PDPR-210ENST00000568530 A0A096LNT2 108 aa5.28□□□□□ -1.56
PDPR-210ENST00000568530 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.28□□□□□ -1.56
PDPR-210ENST00000568530 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.28□□□□□ -1.56
PDPR-210ENST00000568530 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.27□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 A0A1W2PNM2 257 aa5.26□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.26□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.26□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 KLK9Q2XQG4 91 aa5.25□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 MGAQ8IWI9 3026 aa5.24□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.23□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 POLQO75417 2590 aa5.23□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 FRYQ5TBA9 3013 aa5.23□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.22□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PDPR-210ENST00000568530 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.21□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.21□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 DMAC1Q96GE9 116 aa5.21□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.21□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 Q8NDZ9 215 aa5.19□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 MTORP42345 2549 aa5.19□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 LRBAP50851 2863 aa5.19□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 DMDP11532 3685 aa5.19□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.18□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 OXTP01178 125 aa5.18□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.18□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 TRANK1O15050 2925 aa5.17□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 LCE6AA0A183 80 aa5.17□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 PRAC1Q96KF2 57 aa5.17□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 RELNP78509 3460 aa5.17□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 KALRNO60229 2985 aa5.17□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP10-2P60368 255 aa5.16□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP10-1P60331 282 aa5.15□□□□□ -1.58
PDPR-210ENST00000568530 OCR1Q9BZK8 76 aa5.15□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.14□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.14□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 H3BS24 57 aa5.12□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 USP24Q9UPU5 2620 aa5.12□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 ROMO1P60602 79 aa5.1□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.09□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PDPR-210ENST00000568530 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 Q5XG85 94 aa5.09□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 A0A1B0GVY2 172 aa5.08□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 Q5W150 140 aa5.08□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.07□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 ZFHX3Q15911 3703 aa5.06□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 ATMQ13315 3056 aa5.05□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.05□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 ZZEF1O43149 2961 aa5.05□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.03□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.03□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.03□□□□□ -1.6
PDPR-210ENST00000568530 P0C880 135 aa5.02□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 Q75L30 129 aa5.02□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.01□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 AKAP13Q12802 2813 aa5.01□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 A8MUU9 505 aa5.01□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 SPRR1BP22528 89 aa5.01□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 C10orf95Q9H7T3 257 aa5□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 Q5VV11 94 aa5□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.99□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP10-8P60410 259 aa4.98□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.98□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.97□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.97□□□□□ -1.61
PDPR-210ENST00000568530 Q6ZR54 194 aa4.94□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 PANO1I0J062 215 aa4.94□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.94□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 ITPR3Q14573 2671 aa4.93□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.93□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.92□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 TACC2O95359 2948 aa4.91□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 A0A087X002 238 aa4.91□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.91□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 SPRR1AP35321 89 aa4.9□□□□□ -1.62
PDPR-210ENST00000568530 A8MU10 97 aa4.9□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 COL12A1Q99715 3063 aa4.89□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.88□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.88□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.88□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 TNP1P09430 55 aa4.87□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 CHD6Q8TD26 2715 aa4.87□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PDPR-210ENST00000568530 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.85□□□□□ -1.63
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