RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 K7ERJ3 54 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 MOBPQ13875 183 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 Q8N377 158 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTA-215ENST00000560207 CD164Q04900 197 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 TNXBP22105 4242 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 TRACP01848 142 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 Q6JHZ5 121 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 SMIM29Q86T20 159 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 BATFQ16520 125 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 LIMD2Q9BT23 127 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 LST1O00453 97 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 CLEC2BQ92478 149 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTA-215ENST00000560207 ATXN8Q156A1 80 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 HERC1Q15751 4861 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 C9orf118A6NHY6 69 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 FABP2P12104 132 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 UBE2V1Q13404 147 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 Q5XG85 94 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 H3BMG7 143 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 H3BUT2 72 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 TCL1BO95988 128 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 PRR4Q16378 134 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTA-215ENST00000560207 TAX1BP3O14907 124 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 Q6Q795 121 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1W2PPM0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 IGFL1Q6UW32 110 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 TEN1Q86WV5 123 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 PDE6GP18545 87 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 TPRXLQ17RH7 258 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 DSCR8Q96T75 97 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GW54 56 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTA-215ENST00000560207 H3BT86 120 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTA-215ENST00000560207 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGGTA-215ENST00000560207 A0A0G2JQZ4 141 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTA-215ENST00000560207 CCKP06307 115 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTA-215ENST00000560207 C1orf195Q5TG92 126 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-215ENST00000560207 CDIP1Q9H305 208 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTA-215ENST00000560207 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTA-215ENST00000560207 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-215ENST00000560207 K7EP34 96 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTA-215ENST00000560207 Q6ZQT0 140 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-215ENST00000560207 VPS25Q9BRG1 176 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-215ENST00000560207 F8W1H4 67 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-215ENST00000560207 J3KT08 172 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTA-215ENST00000560207 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTA-215ENST00000560207 LRP2P98164 4655 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 XP32Q5T750 250 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 MTURNQ8N3F0 131 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 Q96NJ1 140 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 IGKV4-1P06312 121 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 SIGMAR1Q99720 223 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 NDUFB1O75438 58 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 NREPQ16612 68 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 LPAP08519 4548 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 C9orf92A6NGG3 77 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTA-215ENST00000560207 C8orf87E5RJ46 101 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00313P59037 77 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 ETDBQ3ZM63 59 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GVX0 72 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 A8MWP4 228 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTA-215ENST00000560207 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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