RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB130BP0DP73 79 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB130AP0DP74 79 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 SPRR1BP22528 89 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB123Q8N688 67 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 FBN3Q75N90 2809 aa0.86□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 K7EIL1 84 aa0.85□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 ROS1P08922 2347 aa0.85□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 HTN1P15515 57 aa0.85□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB1P60022 68 aa0.85□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.84□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 PRLHP81277 87 aa0.84□□□□□ -2.27
TMOD3-205ENST00000558714 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.84□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.83□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.83□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.83□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 KNL1Q8NG31 2342 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 PLCE1Q9P212 2302 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 LELP1Q5T871 98 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 PRO0255Q9UI72 69 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 SPINK1P00995 79 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 CACNA1EQ15878 2313 aa0.8□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 APLNQ9ULZ1 77 aa0.8□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 S4R3F8 94 aa0.8□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB136Q30KP8 78 aa0.79□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB133Q30KQ1 61 aa0.79□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 Q5VSD8 79 aa0.79□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.79□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa0.78□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.78□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 A0A0C4DFX4 3053 aa0.78□□□□□ -2.28
TMOD3-205ENST00000558714 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 H3BNG1 76 aa0.77□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 ABCA1O95477 2261 aa0.77□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.76□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 A0A096LPF7 62 aa0.76□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 A0A0D9SG42 100 aa0.76□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 M0QZ58 72 aa0.76□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB124Q8NES8 71 aa0.76□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 LINC01556Q5JQF7 62 aa0.75□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.75□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.75□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.74□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 A0A096LNI7 61 aa0.74□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.74□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 U3KQA8 63 aa0.73□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 AKAP6Q13023 2319 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 IGF2RP11717 2491 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.72□□□□□ -2.29
TMOD3-205ENST00000558714 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.71□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 HTN3P15516 51 aa0.7□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 COL6A3P12111 3177 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 CEP350Q5VT06 3117 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 MGAQ8IWI9 3026 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 ACACAQ13085 2346 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 TNP1P09430 55 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 SPTBN2O15020 2390 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.69□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 SPTA1P02549 2419 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 CACNA1HO95180 2353 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 TENM2Q9NT68 2774 aa0.68□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB135Q30KP9 77 aa0.67□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 JMJD1CQ15652 2540 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 C9orf92A6NGG3 77 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.66□□□□□ -2.3
TMOD3-205ENST00000558714 CEP250Q9BV73 2442 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 DEFB4AO15263 64 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 ZZEF1O43149 2961 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.65□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 F8P00451 2351 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 REV3LO60673 3130 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 CHD6Q8TD26 2715 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 APC2O95996 2303 aa0.64□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 CFAP54Q96N23 3096 aa0.63□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 FBN2P35556 2912 aa0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms