RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778		M0R143	59 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	CFC1	P0CG37	223 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778		H7C2G1	150 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	LPA	P08519	4548 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	FXYD2	P54710	66 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	CEND1	Q8N111	149 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GWB2	263 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	MOBP	Q13875	183 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778		Q8NBF4	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PRKCH-222	ENST00000556778		K7ERJ3	54 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	TAL2	Q16559	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	LRP2	P98164	4655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A0B4J2C4	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR1B	P22528	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	HSD52	Q0P140	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778		Q1RN00	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	PRR4	Q16378	134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778		Q8N377	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778		Q6ZQY7	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC25A20	O43772	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	TRIAP1	O43715	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	SEC61G	P60059	68 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	CLEC2B	Q92478	149 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	SPINK1	P00995	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778		H0YGX0	51 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	PSMB2	P49721	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778		H3BUT2	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	BATF	Q16520	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	FABP2	P12104	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC2	Q02817	5179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778		F8WEM9	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GX51	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778		J3QR89	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	COX6C	P09669	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	CD164	Q04900	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKCH-222	ENST00000556778	SNCG	O76070	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778		H3BMG7	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	LST1	O00453	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	TCL1B	O95988	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778		V9GYY9	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778		Q6JHZ5	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	DNAL4	O96015	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	TRAC	P01848	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKCH-222	ENST00000556778	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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