RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	COX17	Q14061	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	COX6C	P09669	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1B0GV72	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097		H3BT86	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	LST1	O00453	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	UBE2A	P49459	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	HERV-K104	P63124	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	SPRR1A	P35321	89 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	SNCG	O76070	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	TRAC	P01848	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097		Q9BRP9	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	MUC2	Q02817	5179 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097		Q6Q795	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	CRYGA	P11844	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFC2	O95298	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	ACYP1	P07311	99 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	PRR4	Q16378	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097		Q6ZRX8	168 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097		H0YGX0	51 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CCR3-208	ENST00000545097	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	DNAL4	O96015	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097		Q8NBF4	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	MOBP	Q13875	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1B0GX51	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCR3-208	ENST00000545097	COX7B	P24311	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097		Q6JHZ5	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	SPRR1B	P22528	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	CCK	P06307	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097		Q8N377	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCR3-208	ENST00000545097	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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