RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.4□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 PCOTHQ58A44 107 aa6.4□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 IGFL1Q6UW32 110 aa6.4□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 CASC2Q6XLA1 102 aa6.4□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 SMIM29Q86T20 159 aa6.4□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 A0A0U1RQV1 116 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 FAM236CP0DP71 79 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP10-2P60368 255 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 BRK1Q8WUW1 75 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF861PO60384 105 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 CRYGAP11844 174 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1W2PNM2 257 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 K7EQZ3 153 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 COL7A1Q02388 2944 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 HCG22E2RYF7 251 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM258P61165 79 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.34□□□□□ -1.39
TOP3A-208ENST00000542570 FAM229AH3BQW9 127 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV7-43P04211 117 aa6.32□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.32□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 FBN3Q75N90 2809 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV2-30P06310 120 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 CXCL6P80162 114 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP10-1P60331 282 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 SPRR4Q96PI1 79 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 H0Y9P7 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 hDV103S1A0JD37 113 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-208ENST00000542570 SPINK1P00995 79 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf92A6NGG3 77 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 DSCR10P59022 87 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.24□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.23□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 C4orf26Q17RF5 130 aa6.23□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZR54 194 aa6.23□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 Q96NJ1 140 aa6.23□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 LIMD2Q9BT23 127 aa6.21□□□□□ -1.41
TOP3A-208ENST00000542570 SPRR1AP35321 89 aa6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00313P59037 77 aa6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 LINC01600Q96MT4 127 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 A8MWP4 228 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 PSPHP1O15172 72 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 LCE6AA0A183 80 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 PRR15Q8IV56 129 aa6.17□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFC1O43677 76 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-208ENST00000542570 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.15□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.15□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.14□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 J3QL48 77 aa6.14□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1B0GVX0 72 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 PRO0628Q9UI54 55 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1B0GW54 56 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 A0A087X002 238 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3A-208ENST00000542570 V9GYY9 64 aa6.09□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 A6NED7 52 aa6.08□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 C1orf195Q5TG92 126 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 PRR15LQ9BU68 103 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 SEC61GP60059 68 aa6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.04□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 Q5VSD8 79 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.03□□□□□ -1.44
TOP3A-208ENST00000542570 H7BZZ5 65 aa6.02□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 PMAIP1Q13794 54 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 DNHD1Q96M86 4753 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00472Q9H8W2 130 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 SPRR1BP22528 89 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 Q8N1X5 172 aa6□□□□□ -1.45
TOP3A-208ENST00000542570 OCR1Q9BZK8 76 aa5.99□□□□□ -1.45
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