RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 Q1RN00 199 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB37Q96AX2 223 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PYY3Q5JQD4 70 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 HIGD1BQ9P298 99 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 SPINK1P00995 79 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.58□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRR1BP22528 89 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CTAG1AP78358 180 aa6.56□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CEND1Q8N111 149 aa6.56□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 LRP2P98164 4655 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 hADV29S1A0JD25 119 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 F8WEM9 126 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CFC1BP0CG36 223 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CFC1P0CG37 223 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00575Q6W349 94 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0B4J2C4 111 aa6.54□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZQY7 126 aa6.54□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIAP1O43715 76 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 SNCGO76070 127 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 PRO1933Q9H354 126 aa6.53□□□□□ -1.36
UBASH3B-208ENST00000533451 FXYD2P54710 66 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 HSD52Q0P140 79 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N377 158 aa6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 LIMD2Q9BT23 127 aa6.51□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM29Q86T20 159 aa6.5□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0G2JQZ4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 K7ERJ3 54 aa6.49□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 H0YGX0 51 aa6.48□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 PSMB2P49721 201 aa6.48□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 TPRXLQ17RH7 258 aa6.48□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.48□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 LPAP08519 4548 aa6.47□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.47□□□□□ -1.37
UBASH3B-208ENST00000533451 CD164Q04900 197 aa6.46□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.45□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BUT2 72 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PCP4P48539 62 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6JHZ5 121 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 CLEC2BQ92478 149 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAL4O96015 105 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 COX6CP09669 75 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM6P0DI80 62 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP2P12104 132 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 TCL1BO95988 128 aa6.4□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 IGFL1Q6UW32 110 aa6.4□□□□□ -1.38
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF213Q63HN8 5207 aa6.4□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GV72 72 aa6.39□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GX51 115 aa6.39□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.39□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.38□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf92A6NGG3 77 aa6.38□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 M0R143 59 aa6.38□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.37□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 TSTD3H0UI37 97 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BMG7 143 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf195Q5TG92 126 aa6.35□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 Q5XG85 94 aa6.35□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 BATFQ16520 125 aa6.34□□□□□ -1.39
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0U1RQV1 116 aa6.33□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.31□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BQ85 93 aa6.31□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.31□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 LST1O00453 97 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 TRACP01848 142 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 TEN1Q86WV5 123 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A087WSZ3 146 aa6.29□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.29□□□□□ -1.4
UBASH3B-208ENST00000533451 VPS25Q9BRG1 176 aa6.27□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 ATXN8Q156A1 80 aa6.26□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6Q795 121 aa6.26□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.25□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PNM2 257 aa6.24□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 CCKP06307 115 aa6.24□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.24□□□□□ -1.41
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2V1Q13404 147 aa6.24□□□□□ -1.41
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