RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532538.1

BRPF3-210, Transcript of bromodomain and PHD finger containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene BRPF3, Length 567 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3-210ENST00000532538 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.22□□□□□ -1.09
BRPF3-210ENST00000532538 HIST1H4GQ99525 98 aa8.21□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.2□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 HIGD1BQ9P298 99 aa8.2□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.19□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.18□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 A6NDN8 102 aa8.18□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 A0A0G2JQZ4 141 aa8.16□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1B0GWB2 263 aa8.16□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 C1orf195Q5TG92 126 aa8.16□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.15□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 A4D1N5 150 aa8.15□□□□□ -1.1
BRPF3-210ENST00000532538 TCL1BO95988 128 aa8.14□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 SMIM6P0DI80 62 aa8.14□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.14□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.13□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.13□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 F8WEM9 126 aa8.12□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 Q5XG85 94 aa8.12□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 SMIM29Q86T20 159 aa8.12□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 CEND1Q8N111 149 aa8.1□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 HSD52Q0P140 79 aa8.09□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 Q6Q795 121 aa8.09□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 RAB37Q96AX2 223 aa8.09□□□□□ -1.11
BRPF3-210ENST00000532538 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.08□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 VAMP3Q15836 100 aa8.08□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 C12orf57Q99622 126 aa8.08□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.07□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.07□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 A0A0B4J2C4 111 aa8.06□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 CFC1P0CG37 223 aa8.05□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 GHRHP01286 108 aa8.04□□□□□ -1.12
BRPF3-210ENST00000532538 FXYD2P54710 66 aa8.02□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.02□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.02□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.02□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 TSTD3H0UI37 97 aa8.01□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 LCE2BO14633 110 aa8□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.99□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 SNCGO76070 127 aa7.98□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 Q6JHZ5 121 aa7.98□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 Q6ZQY7 126 aa7.98□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.97□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 hADV29S1A0JD25 119 aa7.97□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 M0R143 59 aa7.97□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 CLEC2BQ92478 149 aa7.97□□□□□ -1.13
BRPF3-210ENST00000532538 H0YGX0 51 aa7.96□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 LINC00575Q6W349 94 aa7.96□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 IGFL1Q6UW32 110 aa7.95□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.94□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 K7ERJ3 54 aa7.93□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 LST1O00453 97 aa7.93□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 PSMB2P49721 201 aa7.93□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 Q96NJ1 140 aa7.93□□□□□ -1.14
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BRPF3-210ENST00000532538 COX6CP09669 75 aa7.92□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 Q75L30 129 aa7.92□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
BRPF3-210ENST00000532538 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 TRIAP1O43715 76 aa7.89□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.88□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 A0A1B0GX51 115 aa7.88□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 H3BUT2 72 aa7.87□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.87□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.85□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.85□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 DNAL4O96015 105 aa7.84□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 BATFQ16520 125 aa7.84□□□□□ -1.15
BRPF3-210ENST00000532538 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.83□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 H3BQ85 93 aa7.81□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.8□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 FAM236CP0DP71 79 aa7.8□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.79□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.78□□□□□ -1.16
BRPF3-210ENST00000532538 TRACP01848 142 aa7.77□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 FABP2P12104 132 aa7.77□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 TEN1Q86WV5 123 aa7.77□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.77□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 A0A087WSZ3 146 aa7.76□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 DSCR10P59022 87 aa7.76□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 A8MUU9 505 aa7.75□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.75□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 SIGMAR1Q99720 223 aa7.75□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.74□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 ATXN8Q156A1 80 aa7.74□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 H3BMG7 143 aa7.72□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.72□□□□□ -1.17
BRPF3-210ENST00000532538 C9orf118A6NHY6 69 aa7.71□□□□□ -1.18
BRPF3-210ENST00000532538 LINC00313P59037 77 aa7.69□□□□□ -1.18
BRPF3-210ENST00000532538 UBE2V1Q13404 147 aa7.69□□□□□ -1.18
BRPF3-210ENST00000532538 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.69□□□□□ -1.18
BRPF3-210ENST00000532538 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.69□□□□□ -1.18
BRPF3-210ENST00000532538 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.68□□□□□ -1.18
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