RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 MP68P56378 58 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2AP49459 152 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 PRR4Q16378 134 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR1BP22528 89 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 PRR15Q8IV56 129 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00208Q96KT6 92 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 F8P00451 2351 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 H0Y9J4 135 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 H3BPC8 53 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 C1orf195Q5TG92 126 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 CASC2Q6XLA1 102 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 A8MWP4 228 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 H0Y9P7 68 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 B9D2Q9BPU9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 MAST4O15021 2626 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 PSPHP1O15172 72 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 V9GYY9 64 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 CHTF8P0CG12 524 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 STAB1Q9NY15 2570 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRK-217ENST00000524534 K7EIL1 84 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 NOTCH1P46531 2555 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 C14orf177Q52M58 125 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 A8MUN3 132 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 LYSTQ99698 3801 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 Q5VV11 94 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 Q96NJ1 140 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 LIMD2Q9BT23 127 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 APLNQ9ULZ1 77 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 PANO1I0J062 215 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 COA5Q86WW8 74 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 PMAIP1Q13794 54 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 MOBPQ13875 183 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 COL6A5A8TX70 2615 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRK-217ENST00000524534 A8MU10 97 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZR54 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 PRR15LQ9BU68 103 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00483Q53H64 154 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 CD164Q04900 197 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 PCOTHQ58A44 107 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 Q75L30 129 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 TENM2Q9NT68 2774 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1B0GVX0 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 SEC61GP60059 68 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-217ENST00000524534 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 COL7A1Q02388 2944 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 LCA10Q71F78 164 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFS5O43920 106 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 CDK2AP2O75956 126 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 MDFIQ99750 246 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087X002 238 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 A6NED7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 HRES1P13985 223 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-217ENST00000524534 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.84□□□□□ -1.31
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