RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517021.2

5S_rRNA.3-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TNXBP22105 4242 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 H3BNG1 76 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PRLHP81277 87 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SERF2P84101 59 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SMIM5Q71RC9 77 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa0.08□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CHD6Q8TD26 2715 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 K7EMI3 77 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 NMES1Q9C002 83 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 C3P01024 1663 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.07□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 M0R1W7 72 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SFTA3P0C7M3 94 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 S4R3F8 94 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 LPAP08519 4548 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 REV3LO60673 3130 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KMT2DO14686 5537 aa0.06□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 C9orf92A6NGG3 77 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 WT1-ASQ06250 92 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 MUC5ACP98088 5654 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.05□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ACANP16112 2415 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CACNA1AO00555 2505 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 H3BUA1 57 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 HSPG2P98160 4391 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.04□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 COL7A1Q02388 2944 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 MYCBP2O75592 4640 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ABCA6Q8N139 1617 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KIF1AQ12756 1690 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ATRQ13535 2644 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 FLNCQ14315 2725 aa0.03□□□□□ -2.4
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CPS1P31327 1500 aa0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ERICH3Q5RHP9 1530 aa0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ITSN2Q9NZM3 1697 aa0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SPRR2AP35326 72 aa0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TIAM1Q13009 1591 aa0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KMT2AQ03164 3969 aa0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 EEA1Q15075 1411 aa0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 DEFB110Q30KQ9 67 aa0□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PRXQ9BXM0 1461 aa0□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 NBASA2RRP1 2371 aa-0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.01□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 GLI2P10070 1586 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 BPTFQ12830 3046 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 H0YGX0 51 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 LY75O60449 1722 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 COL6A3P12111 3177 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 LRP2P98164 4655 aa-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 IGIPA6NJ69 53 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SPRR2EP22531 72 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 TRANK1O15050 2925 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 CREBBPQ92793 2442 aa-0.03□□□□□ -2.41
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-0.04□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 ZANQ9Y493 2812 aa-0.04□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.04□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.04□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.05□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.05□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 PLNP26678 52 aa-0.05□□□□□ -2.42
5S_rRNA.3-201ENST00000517021 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms