RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 Q6ZQY7 126 aa8.76□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 H7C2G1 150 aa8.75□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 LIMD2Q9BT23 127 aa8.75□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 A0A0B4J2C4 111 aa8.73□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.73□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 CEND1Q8N111 149 aa8.73□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 RAB37Q96AX2 223 aa8.73□□□□□ -1.01
SERF1B-208ENST00000515588 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 FXYD2P54710 66 aa8.7□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 Q5XG85 94 aa8.7□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.67□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 F8WEM9 126 aa8.67□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.67□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.67□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.67□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 XP32Q5T750 250 aa8.66□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 C1orf195Q5TG92 126 aa8.66□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.66□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 H0YGX0 51 aa8.65□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.65□□□□□ -1.02
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.64□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 A6NJY4 79 aa8.64□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 IGFL1Q6UW32 110 aa8.64□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.64□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 HSD52Q0P140 79 aa8.63□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 Q6JHZ5 121 aa8.63□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.63□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 CLEC2BQ92478 149 aa8.62□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.62□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 A0A0U1RQV1 116 aa8.61□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 C9orf92A6NGG3 77 aa8.61□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 H3BUT2 72 aa8.6□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 K7ERJ3 54 aa8.6□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 TRIAP1O43715 76 aa8.6□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.59□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 TCL1BO95988 128 aa8.59□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.59□□□□□ -1.03
SERF1B-208ENST00000515588 SNCGO76070 127 aa8.58□□□□□ -1.04
SERF1B-208ENST00000515588 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1B0GX51 115 aa8.56□□□□□ -1.04
SERF1B-208ENST00000515588 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SERF1B-208ENST00000515588 PSMB2P49721 201 aa8.51□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 FABP2P12104 132 aa8.5□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 PCOTHQ58A44 107 aa8.5□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 H3BMG7 143 aa8.49□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 Q6Q795 121 aa8.49□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 GHRHP01286 108 aa8.47□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 TEN1Q86WV5 123 aa8.47□□□□□ -1.05
SERF1B-208ENST00000515588 COX6CP09669 75 aa8.46□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.46□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 DNAL4O96015 105 aa8.45□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 LST1O00453 97 aa8.44□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 A0A087WSZ3 146 aa8.43□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.43□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PNM2 257 aa8.43□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.43□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1B0GV72 72 aa8.42□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.42□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 H3BQ85 93 aa8.41□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 SMIM6P0DI80 62 aa8.41□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.4□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 TRACP01848 142 aa8.4□□□□□ -1.06
SERF1B-208ENST00000515588 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.39□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.39□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.39□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 Q96NJ1 140 aa8.39□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.38□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 UBE2V1Q13404 147 aa8.37□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.35□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 M0R143 59 aa8.35□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SERF1B-208ENST00000515588 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.32□□□□□ -1.08
SERF1B-208ENST00000515588 CCKP06307 115 aa8.32□□□□□ -1.08
SERF1B-208ENST00000515588 Q75L30 129 aa8.32□□□□□ -1.08
SERF1B-208ENST00000515588 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.3□□□□□ -1.08
SERF1B-208ENST00000515588 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SERF1B-208ENST00000515588 TSTD3H0UI37 97 aa8.27□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 DSCR10P59022 87 aa8.27□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 SIGMAR1Q99720 223 aa8.27□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.27□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 IGKV4-1P06312 121 aa8.26□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 ATXN8Q156A1 80 aa8.26□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.26□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.26□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 A8MUU9 505 aa8.25□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.25□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 MT1HP80294 61 aa8.24□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 DSCR8Q96T75 97 aa8.24□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 VPS25Q9BRG1 176 aa8.24□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.24□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 BATFQ16520 125 aa8.23□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.22□□□□□ -1.09
SERF1B-208ENST00000515588 C9JAW5 83 aa8.21□□□□□ -1.1
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.2□□□□□ -1.1
SERF1B-208ENST00000515588 LINC00313P59037 77 aa8.2□□□□□ -1.1
SERF1B-208ENST00000515588 Q6ZQT0 140 aa8.17□□□□□ -1.1
SERF1B-208ENST00000515588 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.16□□□□□ -1.1
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