RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513333.1

EPB41L4A-208, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 5

Gene EPB41L4A, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.33	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.33	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.33	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		0.33	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DEFB130B	P0DP73	79 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DEFB130A	P0DP74	79 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	WT1-AS	Q06250	92 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SMR3A	Q99954	134 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NFAT5	O94916	1531 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POLQ	O75417	2590 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DEFB131A	P59861	70 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DEFB135	Q30KP9	77 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LELP1	Q5T871	98 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DEFB106A	Q8N104	65 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333		U3KQA8	63 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APC	P25054	2843 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333		M0R2T5	61 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NDUFA1	O15239	70 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRLH	P81277	87 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF292	O60281	2723 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	REV3L	O60673	3130 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333		S4R3F8	94 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333		A8MTW9	85 aa		0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRANK1	O15050	2925 aa		0.28	□□□□□ -2.36
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.28	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	F8	P00451	2351 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C9orf92	A6NGG3	77 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333		M0QY20	66 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TFF3	Q07654	80 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.27	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IGF2R	P11717	2491 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333		A0A0C4DFX4	3053 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	VWF	P04275	2813 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAST4	O15021	2626 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333		M0QZ58	72 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPTA1	P02549	2419 aa		0.24	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.24	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KMT2D	O14686	5537 aa		0.24	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CREBBP	Q92793	2442 aa		0.24	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333		H3BNG1	76 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TNP1	P09430	55 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPRR2D	P22532	72 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NCOR1	O75376	2440 aa		0.23	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHD6	Q8TD26	2715 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATR	Q13535	2644 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CEP290	O15078	2479 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AKAP13	Q12802	2813 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRM1	P04553	51 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPRR2B	P35325	72 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MYCBP2	O75592	4640 aa		0.21	□□□□□ -2.38
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.21	□□□□□ -2.38

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