RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	ACYP2	P14621	99 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00313	P59037	77 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GU69	56 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	HIVEP1	P15822	2718 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	USP34	Q70CQ2	3546 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	NF1	P21359	2839 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	COA5	Q86WW8	74 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087WTM6	91 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF861P	O60384	105 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	FBN2	P35556	2912 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	DSCR10	P59022	87 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GVX0	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	APC	P25054	2843 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193		Q96NJ1	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEK1-208	ENST00000512193	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	WIPF1	O43516	503 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	SPRR1A	P35321	89 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NEK1-208	ENST00000512193	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193		Q5XG85	94 aa		5	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	OXT	P01178	125 aa		5	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	RELN	P78509	3460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	UQCR11	O14957	56 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	TNP2	Q05952	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEK1-208	ENST00000512193	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193		Q1T7F1	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N1X5	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	SPRR1B	P22528	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	LAMA5	O15230	3695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	HRES1	P13985	223 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NEK1-208	ENST00000512193	CD164	Q04900	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193	PANO1	I0J062	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193		Q5VV11	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193		Q75L30	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	LCA10	Q71F78	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193		Q5W150	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	DMD	P11532	3685 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK7	P58062	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0D9SG42	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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