RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB37Q96AX2 223 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 FXYD2P54710 66 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 XP32Q5T750 250 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 CEND1Q8N111 149 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 F8WEM9 126 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf92A6NGG3 77 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 Q5XG85 94 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf195Q5TG92 126 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFL1Q6UW32 110 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQV1 116 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BUT2 72 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 K7ERJ3 54 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC2BQ92478 149 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NJY4 79 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PRO1854Q9UHT4 67 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIAP1O43715 76 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD52Q0P140 79 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6JHZ5 121 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YGX0 51 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-218ENST00000511185 TCL1BO95988 128 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 PCOTHQ58A44 107 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GX51 115 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 SNCGO76070 127 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 FABP2P12104 132 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB2P49721 201 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GV72 72 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BMG7 143 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6Q795 121 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAL4O96015 105 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 TEN1Q86WV5 123 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WSZ3 146 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PNM2 257 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 LST1O00453 97 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 LCE2CQ5TA81 110 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 Q96NJ1 140 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 COX6CP09669 75 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 GHRHP01286 108 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM6P0DI80 62 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TRACP01848 142 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 Q75L30 129 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BQ85 93 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R143 59 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2V1Q13404 147 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SIGMAR1Q99720 223 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CCKP06307 115 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DSCR10P59022 87 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 MT1HP80294 61 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS25Q9BRG1 176 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV4-1P06312 121 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SH3BP2-218ENST00000511185 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 A8MUU9 505 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TSTD3H0UI37 97 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN8Q156A1 80 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 BATFQ16520 125 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 DSCR8Q96T75 97 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 C9JAW5 83 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00313P59037 77 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZQT0 140 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GVX0 72 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 TAX1BP3O14907 124 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP2-218ENST00000511185 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms