RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB130BP0DP73 79 aa0.53□□□□□ -2.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB130AP0DP74 79 aa0.53□□□□□ -2.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.53□□□□□ -2.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBN2P35556 2912 aa0.52□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCC2Q8IWJ2 1684 aa0.52□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.51□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.51□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 APCP25054 2843 aa0.51□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTBN2O15020 2390 aa0.5□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.5□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WT1-ASQ06250 92 aa0.49□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TFF3Q07654 80 aa0.49□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.49□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.49□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.49□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KNL1Q8NG31 2342 aa0.48□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MROH2BQ7Z745 1585 aa0.48□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLQO75417 2590 aa0.48□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.47□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMR3AQ99954 134 aa0.47□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.47□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 S4R3F8 94 aa0.47□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.47□□□□□ -2.33
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H3BUA1 57 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB106AQ8N104 65 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF292O60281 2723 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 F8P00451 2351 aa0.46□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NDUFA1O15239 70 aa0.45□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.45□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.45□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.45□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPINK1P00995 79 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRLHP81277 87 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.44□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 M0R2T5 61 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB135Q30KP9 77 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIEZO1Q92508 2521 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCOR1O75376 2440 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MDN1Q9NU22 5596 aa0.43□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGF2RP11717 2491 aa0.42□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 U3KQA8 63 aa0.42□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.42□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AKAP6Q13023 2319 aa0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H0YGG7 62 aa0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VWFP04275 2813 aa0.41□□□□□ -2.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.4□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DEFB131AP59861 70 aa0.4□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BSNQ9UPA5 3926 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNXBP22105 4242 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRM1P04553 51 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 REV3LO60673 3130 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TENM4Q6N022 2769 aa0.39□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MUC5ACP98088 5654 aa0.38□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 M0QY20 66 aa0.36□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.35□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTA1P02549 2419 aa0.35□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.35□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHD6Q8TD26 2715 aa0.34□□□□□ -2.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP290O15078 2479 aa0.34□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCBP2O75592 4640 aa0.34□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KMT2AQ03164 3969 aa0.34□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATRQ13535 2644 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C9orf92A6NGG3 77 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A8MTW9 85 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRR2DP22532 72 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRANK1O15050 2925 aa0.33□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPL39P62891 51 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NBASA2RRP1 2371 aa0.32□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.32□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LPAP08519 4548 aa0.31□□□□□ -2.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms