RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 M0R2T5 61 aa8.8□□□□□ -1
ITGA3-211ENST00000508100 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.8□□□□□ -1
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-211ENST00000508100 Q5XG85 94 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-211ENST00000508100 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-211ENST00000508100 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf195Q5TG92 126 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H4GQ99525 98 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GWB2 263 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 A4D1N5 150 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM29Q86T20 159 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0G2JQZ4 141 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 TCL1BO95988 128 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 A6NDN8 102 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 HSD52Q0P140 79 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 CEND1Q8N111 149 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 C12orf57Q99622 126 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0B4J2C4 111 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 A6NJY4 79 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 FXYD2P54710 66 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGA3-211ENST00000508100 F8WEM9 126 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 CFC1P0CG37 223 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 TSTD3H0UI37 97 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 RAB37Q96AX2 223 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 VAMP3Q15836 100 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 Q6Q795 121 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGA3-211ENST00000508100 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 Q6JHZ5 121 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 CLEC2BQ92478 149 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 M0R143 59 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00575Q6W349 94 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGA3-211ENST00000508100 K7ERJ3 54 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZQY7 126 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 Q75L30 129 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 hADV29S1A0JD25 119 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 IGFL1Q6UW32 110 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 H0YGX0 51 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 TRIAP1O43715 76 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGA3-211ENST00000508100 LST1O00453 97 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 Q96NJ1 140 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GX51 115 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 COX6CP09669 75 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 PSMB2P49721 201 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 H3BUT2 72 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGA3-211ENST00000508100 SNCGO76070 127 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 BATFQ16520 125 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.37□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 A8MUU9 505 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 DNAL4O96015 105 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 GHRHP01286 108 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 TRACP01848 142 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 TEN1Q86WV5 123 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 TAX1BP3O14907 124 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 A0A087WSZ3 146 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 C9orf118A6NHY6 69 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 H3BQ85 93 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 FAM236CP0DP71 79 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGA3-211ENST00000508100 DSCR10P59022 87 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 ATXN8Q156A1 80 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 USH2AO75445 5202 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1W2PPM0 123 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 FABP2P12104 132 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 SIGMAR1Q99720 223 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 H3BMG7 143 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 SSPOA2VEC9 5147 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 MT2AP02795 61 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00313P59037 77 aa8.22□□□□□ -1.09
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2V1Q13404 147 aa8.21□□□□□ -1.1
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