RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495530.5

PTPRE-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRE, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-211ENST00000495530 H3BQ85 93 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRE-211ENST00000495530 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRE-211ENST00000495530 Q6ZQY7 126 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRE-211ENST00000495530 LRP2P98164 4655 aa8.83□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.83□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.83□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.82□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 OXTP01178 125 aa8.82□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.82□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.82□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.81□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.81□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 SPRR4Q96PI1 79 aa8.81□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.81□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.8□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.8□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.8□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 H3BMG7 143 aa8.79□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 K7EP34 96 aa8.79□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.79□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 SPRR1BP22528 89 aa8.78□□□□□ -1
PTPRE-211ENST00000495530 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00483Q53H64 154 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 Q8N377 158 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 C9JAW5 83 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 A0A1B0GV90 55 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 CRYGAP11844 174 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 UBE2V1Q13404 147 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 F8WEM9 126 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 H3BT86 120 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRE-211ENST00000495530 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 F8W1H4 67 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 SMIM29Q86T20 159 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 LINC01600Q96MT4 127 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 MTURNQ8N3F0 131 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 A0A087X002 238 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 PRO0461Q9UI25 63 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRE-211ENST00000495530 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 Q6JHZ5 121 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 Q8NBF4 154 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 MOBPQ13875 183 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 TNXBP22105 4242 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 DSCR8Q96T75 97 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 PDE6GP18545 87 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP10-8P60410 259 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 A0A1B0GV72 72 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 TEN1Q86WV5 123 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 IGFL1Q6UW32 110 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 CD164Q04900 197 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 ETDBQ3ZM63 59 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 MT1HL1P0DM35 61 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRE-211ENST00000495530 SPINK1P00995 79 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 CCKP06307 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 Q6Q795 121 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 Q6ZQT0 140 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 A0A0G2JQZ4 141 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 A0A1B0GW54 56 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 VPS25Q9BRG1 176 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 A0A1W2PNM2 257 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRE-211ENST00000495530 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 LIMD2Q9BT23 127 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 Q5XG85 94 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 A0A087WSZ3 146 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 J3QR89 54 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRE-211ENST00000495530 MUC2Q02817 5179 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 A0A0U1RQV1 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 ACYP1P07311 99 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 NREPQ16612 68 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRE-211ENST00000495530 LPAP08519 4548 aa8.32□□□□□ -1.08
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