RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 HRES1P13985 223 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 Q1T7F1 81 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.34□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 LAMA3Q16787 3333 aa10.32□□□□□ -0.76
NISCH-213ENST00000489895 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
NISCH-213ENST00000489895 LINC01554Q52M75 96 aa10.31□□□□□ -0.76
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-1P60331 282 aa10.3□□□□□ -0.76
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZR54 194 aa10.27□□□□□ -0.76
NISCH-213ENST00000489895 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 A0A0D9SG42 100 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-2P60368 255 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 LINC00483Q53H64 154 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 Q5VSD8 79 aa10.27□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 CFAP54Q96N23 3096 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.24□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 Q5W150 140 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 NOTCH1P46531 2555 aa10.21□□□□□ -0.77
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GU33 70 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 CSAG1Q6PB30 78 aa10.21□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.2□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.19□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 Q75L30 129 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 LCA10Q71F78 164 aa10.18□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 SPINK7P58062 85 aa10.17□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 M0R2T5 61 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 S4R3F8 94 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-213ENST00000489895 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-213ENST00000489895 A0A0C4DFX4 3053 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-213ENST00000489895 PANO1I0J062 215 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-213ENST00000489895 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.1□□□□□ -0.79
NISCH-213ENST00000489895 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.08□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 DMAC1Q96GE9 116 aa10.07□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 BRCA2P51587 3418 aa10.06□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 ITPR2Q14571 2701 aa10.02□□□□□ -0.8
NISCH-213ENST00000489895 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 OXTP01178 125 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.98□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 A0A087X002 238 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 Q5XG85 94 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
NISCH-213ENST00000489895 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 TRIOO75962 3097 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 R4GN34 69 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 ITPR1Q14643 2758 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 Q5VV11 94 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-213ENST00000489895 FRYQ5TBA9 3013 aa9.9□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 FLNCQ14315 2725 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 LUZP6Q538Z0 58 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-213ENST00000489895 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 HIVEP1P15822 2718 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 CDH23Q9H251 3354 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 ATMQ13315 3056 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 M0QZ58 72 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-213ENST00000489895 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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NISCH-213ENST00000489895 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
NISCH-213ENST00000489895 COL12A1Q99715 3063 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-213ENST00000489895 TACC2O95359 2948 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-213ENST00000489895 FRYLO94915 3013 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-213ENST00000489895 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-213ENST00000489895 ROMO1P60602 79 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-213ENST00000489895 APCP25054 2843 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-213ENST00000489895 PRAC1Q96KF2 57 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-213ENST00000489895 KALRNO60229 2985 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-213ENST00000489895 SZT2Q5T011 3432 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 PLAC4Q8WY50 150 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.57□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 11.3
NISCH-213ENST00000489895 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 LAMA1P25391 3075 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 TENM4Q6N022 2769 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 LRBAP50851 2863 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.53□□□□□ -0.88
NISCH-213ENST00000489895 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.52□□□□□ -0.89
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