RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487530.2

LYST-210, Transcript of lysosomal trafficking regulator, humanhuman

TSL 4

Gene LYST, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYST-210ENST00000487530 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.28□□□□□ -2.61
LYST-210ENST00000487530 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-1.28□□□□□ -2.61
LYST-210ENST00000487530 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-1.28□□□□□ -2.61
LYST-210ENST00000487530 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.28□□□□□ -2.61
LYST-210ENST00000487530 MRC2Q9UBG0 1479 aa-1.29□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 TMEM218A2RU14 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-1.29□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 ARHGAP5Q13017 1502 aa-1.3□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 NMSQ5H8A3 153 aa-1.3□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 GNG8Q9UK08 70 aa-1.3□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 CUL7Q14999 1698 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 CORTO00230 105 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 NDUFA3O95167 84 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 PRO3102Q9H379 93 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 UTRNP46939 3433 aa-1.31□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 NDUFC1O43677 76 aa-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 UQCRHP07919 91 aa-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 LEAP2Q969E1 77 aa-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.32□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.33□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 VPS13AQ96RL7 3174 aa-1.33□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 PLXNC1O60486 1568 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 C4AP0C0L4 1744 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 C4BP0C0L5 1744 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 M0QZ58 72 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 GNGT2O14610 69 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 DLEU1O43261 78 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.34□□□□□ -2.62
LYST-210ENST00000487530 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 A0A1B0GV90 55 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 F8WEM9 126 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ABCC5O15440 1437 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 EEA1Q15075 1411 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MAPKBP1O60336 1514 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 CUX1P39880 1505 aa-1.35□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 TMEM203Q969S6 136 aa-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 TRGV9Q99603 122 aa-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 NALCNQ8IZF0 1738 aa-1.37□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 EFCAB10A6NFE3 127 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 D6R8Y8 96 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MT-ATP8P03928 68 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 LINC00158P58513 81 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-1.38□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 LEPROTL1O95214 131 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MPC2O95563 127 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.39□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 C3orf79P0CE67 100 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 IGLC3P0DOY3 106 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ATP7BP35670 1465 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 MLH3Q9UHC1 1453 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 LRRC7Q96NW7 1537 aa-1.4□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.41□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 PZPP20742 1482 aa-1.41□□□□□ -2.63
LYST-210ENST00000487530 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.41□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-1.41□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ERVK-7P63135 1459 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 IAPPP10997 89 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 COX7BP24311 80 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 HMGN3Q15651 99 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ABCC2Q92887 1545 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.42□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.43□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-1.43□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CLASP1Q7Z460 1538 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.44□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms