RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BUT2 72 aa6.81□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.8□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BQ85 93 aa6.8□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 LST1O00453 97 aa6.8□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRACP01848 142 aa6.8□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 FABP2P12104 132 aa6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATXN8Q156A1 80 aa6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.79□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A087X002 238 aa6.78□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PPM0 123 aa6.78□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 MT1HL1P0DM35 61 aa6.78□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.78□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q8N377 158 aa6.77□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.77□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 TNXBP22105 4242 aa6.77□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCL1BO95988 128 aa6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-8P60410 259 aa6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 F8WEM9 126 aa6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.75□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM29Q86T20 159 aa6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q8NBF4 154 aa6.74□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.73□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.73□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.73□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 MOBPQ13875 183 aa6.72□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.72□□□□□ -1.33
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2V1Q13404 147 aa6.7□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6JHZ5 121 aa6.7□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.69□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BMG7 143 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7EP34 96 aa6.68□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9JAW5 83 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.67□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BT86 120 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.66□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCE2BO14633 110 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCP4P48539 62 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD164Q04900 197 aa6.65□□□□□ -1.34
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPINK1P00995 79 aa6.64□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.63□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.63□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGFL1Q6UW32 110 aa6.62□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 DSCR8Q96T75 97 aa6.61□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6Q795 121 aa6.6□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 LIMD2Q9BT23 127 aa6.6□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 PDE6GP18545 87 aa6.59□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 MTURNQ8N3F0 131 aa6.59□□□□□ -1.35
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.58□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GV72 72 aa6.58□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 F8W1H4 67 aa6.58□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 TEN1Q86WV5 123 aa6.58□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRO0461Q9UI25 63 aa6.58□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q5XG85 94 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.57□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0G2JQZ4 141 aa6.56□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCKP06307 115 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.55□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GV90 55 aa6.54□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GW54 56 aa6.53□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PNM2 257 aa6.53□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.53□□□□□ -1.36
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZQT0 140 aa6.52□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.51□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 VPS25Q9BRG1 176 aa6.51□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A087WSZ3 146 aa6.5□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCE2CQ5TA81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.48□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.47□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 ETDBQ3ZM63 59 aa6.47□□□□□ -1.37
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRR4Q16378 134 aa6.46□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRP2P98164 4655 aa6.46□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf195Q5TG92 126 aa6.45□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.44□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 TPRXLQ17RH7 258 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q96NJ1 140 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.4□□□□□ -1.38
ARHGEF3-211ENST00000486829 LPAP08519 4548 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-211ENST00000486829 J3KT08 172 aa6.39□□□□□ -1.39
ARHGEF3-211ENST00000486829 NREPQ16612 68 aa6.38□□□□□ -1.39
ARHGEF3-211ENST00000486829 SIGMAR1Q99720 223 aa6.37□□□□□ -1.39
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV4-1P06312 121 aa6.36□□□□□ -1.39
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