RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 K7ERJ3 54 aa7.38□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 SLC25A20O43772 301 aa7.38□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 Q1RN00 199 aa7.38□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZQY7 126 aa7.38□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.37□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.37□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 SPINK1P00995 79 aa7.36□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.36□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 TRIAP1O43715 76 aa7.35□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.35□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 MUC17Q685J3 4493 aa7.35□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 H0YGX0 51 aa7.34□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GX51 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.3□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 CLEC2BQ92478 149 aa7.3□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 A0A0G2JQZ4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 TSTD3H0UI37 97 aa7.29□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.28□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 M0R143 59 aa7.28□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 CD164Q04900 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SSR4-211ENST00000486204 PSMB2P49721 201 aa7.27□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.27□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 F8WEM9 126 aa7.26□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 SNCGO76070 127 aa7.24□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 COX6CP09669 75 aa7.24□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 TPRXLQ17RH7 258 aa7.24□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 IGFL1Q6UW32 110 aa7.23□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 LIMD2Q9BT23 127 aa7.23□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.23□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 Q5XG85 94 aa7.22□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 Q6JHZ5 121 aa7.22□□□□□ -1.25
SSR4-211ENST00000486204 H3BUT2 72 aa7.21□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 LST1O00453 97 aa7.21□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 DNAL4O96015 105 aa7.2□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.2□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 TRACP01848 142 aa7.19□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.19□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 GHRHP01286 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 FABP2P12104 132 aa7.18□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 CDIP1Q9H305 208 aa7.18□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.17□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.17□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 BATFQ16520 125 aa7.17□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 H3BMG7 143 aa7.15□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 H3BQ85 93 aa7.15□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 TCL1BO95988 128 aa7.15□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 C1orf195Q5TG92 126 aa7.15□□□□□ -1.26
SSR4-211ENST00000486204 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.14□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 Q6Q795 121 aa7.14□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.13□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 TAX1BP3O14907 124 aa7.12□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 UBE2V1Q13404 147 aa7.12□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.11□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GV72 72 aa7.1□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 A0A1W2PNM2 257 aa7.1□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 ATXN8Q156A1 80 aa7.1□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 TEN1Q86WV5 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 C9orf118A6NHY6 69 aa7.09□□□□□ -1.27
SSR4-211ENST00000486204 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.08□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.08□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.07□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 XP32Q5T750 250 aa7.07□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.07□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.06□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 A0A1W2PPM0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 A0A087WSZ3 146 aa7.05□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.05□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 C9orf92A6NGG3 77 aa7.04□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 CCKP06307 115 aa7.03□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 Q96NJ1 140 aa7.03□□□□□ -1.28
SSR4-211ENST00000486204 C9JAW5 83 aa7.02□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.01□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 DSCR8Q96T75 97 aa6.99□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.98□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.98□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 MTURNQ8N3F0 131 aa6.98□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.98□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 H3BT86 120 aa6.97□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZQT0 140 aa6.97□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.97□□□□□ -1.29
SSR4-211ENST00000486204 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 VPS25Q9BRG1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.95□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 LCE2CQ5TA81 110 aa6.94□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.94□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 K7EP34 96 aa6.91□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 IGKV4-1P06312 121 aa6.91□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 251.6 ms