RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 LINC00032P0C843 101 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 C3orf79P0CE67 100 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 DPY30Q9C005 99 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 ATP7BP35670 1465 aa-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.57□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 H0YAA0 97 aa-1.58□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 PLGLAQ15195 96 aa-1.58□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.58□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.58□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.59□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.59□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 NESP48681 1621 aa-1.59□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.59□□□□□ -2.66
TTC3-211ENST00000460328 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 DEFB1P60022 68 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 S100PP25815 95 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 NWD1Q149M9 1564 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 WIZO95785 1651 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 FANCAO15360 1455 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 ATP10BO94823 1461 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 PEA15Q15121 130 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 LTN1O94822 1766 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CYB5AP00167 134 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 RBP2P50120 134 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 RELNP78509 3460 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CEP290O15078 2479 aa-1.64□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.64□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.64□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 ACYP1P07311 99 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.66□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.66□□□□□ -2.67
TTC3-211ENST00000460328 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.66□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 IAPPP10997 89 aa-1.66□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 SMIM11AP58511 58 aa-1.66□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 ACACBO00763 2458 aa-1.67□□□□□ -2.68
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TTC3-211ENST00000460328 IFI6P09912 130 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 DEPDC5O75140 1603 aa-1.67□□□□□ -2.68
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TTC3-211ENST00000460328 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.68□□□□□ -2.68
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TTC3-211ENST00000460328 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 M0R143 59 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.69□□□□□ -2.68
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TTC3-211ENST00000460328 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 LCE6AA0A183 80 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 GYPAP02724 150 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.71□□□□□ -2.68
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TTC3-211ENST00000460328 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.72□□□□□ -2.68
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.72□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.73□□□□□ -2.69
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TTC3-211ENST00000460328 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.73□□□□□ -2.69
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TTC3-211ENST00000460328 NDUFB1O75438 58 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 AKAP12Q02952 1782 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 NDUFA4O00483 81 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
TTC3-211ENST00000460328 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.78□□□□□ -2.69
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