RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 PLAC4Q8WY50 150 aa7.4□□□□□ -1.22
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.4□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPRR1AP35321 89 aa7.4□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.39□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.37□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.37□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.36□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 STAB1Q9NY15 2570 aa7.35□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 SPRR1BP22528 89 aa7.34□□□□□ -1.23
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.34□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 OXTP01178 125 aa7.33□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 Q5VSD8 79 aa7.32□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
VWDE-203ENST00000452576 Q6ZR54 194 aa7.27□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.24□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 LCE6AA0A183 80 aa7.23□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-1P60331 282 aa7.21□□□□□ -1.25
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.21□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 PANO1I0J062 215 aa7.19□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.19□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-2P60368 255 aa7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.18□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 PCNTO95613 3336 aa7.17□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 ITPR3Q14573 2671 aa7.17□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 A8MU10 97 aa7.16□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VWDE-203ENST00000452576 BPTFQ12830 3046 aa7.14□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 UTRNP46939 3433 aa7.13□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 NDUFAF8A1L188 74 aa7.12□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.1□□□□□ -1.27
VWDE-203ENST00000452576 A8MUU9 505 aa7.09□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 A6NN06 94 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 CEP350Q5VT06 3117 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 A0A087X002 238 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.08□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
VWDE-203ENST00000452576 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.01□□□□□ -1.29
VWDE-203ENST00000452576 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.98□□□□□ -1.29
VWDE-203ENST00000452576 TNP1P09430 55 aa6.94□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 C5orf42Q9H799 3197 aa6.93□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.93□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 NOTCH1P46531 2555 aa6.92□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 COL6A5A8TX70 2615 aa6.92□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.89□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 A0A0C4DFX4 3053 aa6.88□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 CENPEQ02224 2701 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 CFAP54Q96N23 3096 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.86□□□□□ -1.31
VWDE-203ENST00000452576 AKAP13Q12802 2813 aa6.83□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.82□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.8□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.8□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.78□□□□□ -1.32
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.74□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.74□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 CHD6Q8TD26 2715 aa6.73□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-8P60410 259 aa6.72□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
VWDE-203ENST00000452576 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 PP632Q6XCG6 107 aa6.69□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.67□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.66□□□□□ -1.34
VWDE-203ENST00000452576 A0A1B0GVY2 172 aa6.64□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 BRCA2P51587 3418 aa6.62□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 MGAQ8IWI9 3026 aa6.61□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.6□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 ZNF292O60281 2723 aa6.59□□□□□ -1.35
VWDE-203ENST00000452576 P0C880 135 aa6.58□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 LAMA3Q16787 3333 aa6.57□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 TRIOO75962 3097 aa6.55□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 HTTP42858 3142 aa6.54□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 H0YAA0 97 aa6.53□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VWDE-203ENST00000452576 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.51□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.5□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.49□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 XP32Q5T750 250 aa6.48□□□□□ -1.37
VWDE-203ENST00000452576 FRYQ5TBA9 3013 aa6.45□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-10P60014 251 aa6.44□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 ITPR2Q14571 2701 aa6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.42□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.42□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.41□□□□□ -1.38
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