RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442515.5

LINC00642-202, long intergenic non-protein coding RNA 642, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00642, Length 670 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00642-202ENST00000442515 Q9BRP9 147 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 LIMD2Q9BT23 127 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 A0A0U1RRA0 63 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 SMIM13P0DJ93 91 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 A0A0B4J2C4 111 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 A4D1N5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 TAX1BP3O14907 124 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00642-202ENST00000442515 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 Q6ZRX8 168 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 C9orf118A6NHY6 69 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 K7ERJ3 54 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 A0A1B0GV90 55 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 NPC2P61916 151 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 Q6Q795 121 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 RAB37Q96AX2 223 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
LINC00642-202ENST00000442515 H3BUT2 72 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 NDUFC2O95298 119 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 A0A1W2PPM0 123 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 FABP2P12104 132 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 VAMP3Q15836 100 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 Q1RN00 199 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00642-202ENST00000442515 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 H7C2G1 150 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 K7EP34 96 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 C1orf195Q5TG92 126 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 MT2AP02795 61 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 COX6CP09669 75 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 SPRR1BP22528 89 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 PSMB2P49721 201 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 CD164Q04900 197 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 UBE2V1Q13404 147 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 TRIAP1O43715 76 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 Q5XG85 94 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 MT1FP04733 61 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00642-202ENST00000442515 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 TCL1BO95988 128 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 ATXN8Q156A1 80 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 SMIM29Q86T20 159 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 H0YGX0 51 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 NEBP20929 6669 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 H3BMG7 143 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 LST1O00453 97 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00642-202ENST00000442515 F8W1H4 67 aa7.09□□□□□ -1.27
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LINC00642-202ENST00000442515 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 CLEC2BQ92478 149 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 A0A0G2JQZ4 141 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 A0A1B0GX51 115 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 C6orf99Q4VX62 202 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 Q75L30 129 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 KRTAP10-10P60014 251 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 PRO0461Q9UI25 63 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 C9JAW5 83 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 H3BT86 120 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 SNCGO76070 127 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LINC00642-202ENST00000442515 DNAL4O96015 105 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 COX7BP24311 80 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 LINC00575Q6W349 94 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 MTURNQ8N3F0 131 aa7□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7□□□□□ -1.29
LINC00642-202ENST00000442515 hADV29S1A0JD25 119 aa6.98□□□□□ -1.29
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