RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.09□□□□□ -1.27
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SEMA4D-211ENST00000438547 FLNCQ14315 2725 aa6.74□□□□□ -1.33
SEMA4D-211ENST00000438547 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.74□□□□□ -1.33
SEMA4D-211ENST00000438547 COL12A1Q99715 3063 aa6.73□□□□□ -1.33
SEMA4D-211ENST00000438547 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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SEMA4D-211ENST00000438547 ZZEF1O43149 2961 aa6.72□□□□□ -1.33
SEMA4D-211ENST00000438547 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.7□□□□□ -1.34
SEMA4D-211ENST00000438547 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-211ENST00000438547 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SEMA4D-211ENST00000438547 Q6ZR54 194 aa6.67□□□□□ -1.34
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00483Q53H64 154 aa6.66□□□□□ -1.34
SEMA4D-211ENST00000438547 DMAC1Q96GE9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
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SEMA4D-211ENST00000438547 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.64□□□□□ -1.35
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SEMA4D-211ENST00000438547 LUZP6Q538Z0 58 aa6.62□□□□□ -1.35
SEMA4D-211ENST00000438547 ITPR2Q14571 2701 aa6.62□□□□□ -1.35
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SEMA4D-211ENST00000438547 ZANQ9Y493 2812 aa6.56□□□□□ -1.36
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SEMA4D-211ENST00000438547 A8MU10 97 aa6.56□□□□□ -1.36
SEMA4D-211ENST00000438547 KRTAP10-1P60331 282 aa6.56□□□□□ -1.36
SEMA4D-211ENST00000438547 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-211ENST00000438547 KRTAP10-2P60368 255 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-211ENST00000438547 S4R3F8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-211ENST00000438547 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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