RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437607.1

PTPRF-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-208ENST00000437607 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 C9JAW5 83 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 ERC2-IT1O76042 136 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 GHRHP01286 108 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 MUC2Q02817 5179 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 H3BQ85 93 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 MTURNQ8N3F0 131 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 H3BT86 120 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRF-208ENST00000437607 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 SPRR4Q96PI1 79 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 UBE2V1Q13404 147 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 F8WEM9 126 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 Q8N377 158 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 F8W1H4 67 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 SPRR1BP22528 89 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 LINC00483Q53H64 154 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 PRO0461Q9UI25 63 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRF-208ENST00000437607 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 A0A1B0GV72 72 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 SMIM29Q86T20 159 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 TEN1Q86WV5 123 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 Q8NBF4 154 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 MUC17Q685J3 4493 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 CRYGAP11844 174 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 MOBPQ13875 183 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRF-208ENST00000437607 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 ETDBQ3ZM63 59 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 DSCR8Q96T75 97 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 A0A087X002 238 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 Q6JHZ5 121 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 PDE6GP18545 87 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 PRR4Q16378 134 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRF-208ENST00000437607 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 IGFL1Q6UW32 110 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 VPS25Q9BRG1 176 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 Q6ZQT0 140 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 CCKP06307 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 A0A0G2JQZ4 141 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRF-208ENST00000437607 J3QR89 54 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 A0A1W2PNM2 257 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 Q6Q795 121 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 CD164Q04900 197 aa7□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 A0A0U1RQV1 116 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 A0A087WSZ3 146 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 LIMD2Q9BT23 127 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 A0A1B0GW54 56 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-208ENST00000437607 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 K7ERU9 68 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 SPINK1P00995 79 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 ACYP1P07311 99 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 UBL5Q9BZL1 73 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 NREPQ16612 68 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 LINC00846Q9NV44 126 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-208ENST00000437607 Q5XG85 94 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 Q6ZVQ6 151 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 TPRXLQ17RH7 258 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 SIGMAR1Q99720 223 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 CDIP1Q9H305 208 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-208ENST00000437607 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.83□□□□□ -1.32
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