RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 ADIRFQ15847 76 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CLLU1Q5K131 121 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZQT0 140 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HIST3H2BBQ8N257 126 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00526Q96FQ7 95 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SEC11CQ9BY50 192 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM126AQ9H061 195 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 ALMS1Q8TCU4 4167 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 MUC4Q99102 2169 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM218A2RU14 115 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01546A6NGU7 62 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFA1O15239 70 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CRYGAP11844 174 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CKS1BP61024 79 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM258P61165 79 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 COX6A2Q02221 97 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 COX17Q14061 63 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 Q8N8P6 123 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CARD19Q96LW7 228 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01600Q96MT4 127 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 PRELID3AQ96N28 172 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.14□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HERC2O95714 4834 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 PKHD1P08F94 4074 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 D6R8Y8 96 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 H3BRM9 83 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 J3KT08 172 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 RPS28P62857 69 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 WFDC2Q14508 124 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFA5Q16718 116 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 Q8IZM0 81 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SVBPQ8N300 66 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DIRC1Q969H9 104 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 AMELXQ99217 191 aa1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH10Q8IVF4 4471 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGIPA6NJ69 53 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 F8VRH5 84 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 M0R378 163 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TAX1BP3O14907 124 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NUPR1O60356 82 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2D1P51668 147 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 AKR1D1P51857 326 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NDUFA6P56556 154 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SPAG11BQ08648 103 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 VPS25Q9BRG1 176 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 RYR1P21817 5038 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1109Q2LD37 5005 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH17Q9UFH2 4485 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 S100A1P23297 94 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CLPSL2Q6UWE3 100 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 C5orf38Q86SI9 138 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 CST9LQ9H4G1 147 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HSPB8Q9UJY1 196 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 PKD1P98161 4303 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DNAH6Q9C0G6 4158 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GX51 115 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TCL1BO95988 128 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 TRGC2P03986 189 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 COPS9Q8WXC6 57 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SMCO4Q9NRQ5 59 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 NEBP20929 6669 aa1.11□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HSPG2P98160 4391 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 A0A096LNI7 61 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 J3QR89 54 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 BCE1O60756 84 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 RPL39P62891 51 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2BP63146 152 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf137Q5JT78 98 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 SPAG11AQ6PDA7 123 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 C7orf65Q6ZTY9 151 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 Q6ZUT4 128 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 COX7B2Q8TF08 81 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H2BLQ99880 126 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 C22orf24Q9Y442 160 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.1□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa1.09□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 DPM2O94777 84 aa1.09□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 HBDP02042 147 aa1.09□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 IGLC3P0DOY3 106 aa1.09□□□□□ -2.23
CCDC82-202ENST00000423339 FABP2P12104 132 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms