RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-38P-201ENST00000384085 WIZO95785 1651 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAUP35544 74 aaKnown RBP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-38P-201ENST00000384085 NESP48681 1621 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 C20orf202A1L168 122 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLGLAQ15195 96 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB106AQ8N104 65 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP7BP35670 1465 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEPDC5O75140 1603 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 NWD1Q149M9 1564 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYB5AP00167 134 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT1XP80297 61 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 WFDC9Q8NEX5 89 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf42Q9H799 3197 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYH4Q9Y623 1939 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-2.82□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-2.82□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-2.83□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-2.83□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 S100A10P60903 97 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00587B1AMM8 73 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFI6P09912 130 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 IAPPP10997 89 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 FANCAO15360 1455 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYNX1G3V0Z9 82 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00032P0C843 101 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLIN4Q96Q06 1357 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 LTN1O94822 1766 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX14Q8IWB6 1497 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM11AP58511 58 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP10BO94823 1461 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCE6AA0A183 80 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEA15Q15121 130 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPY30Q9C005 99 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL6A5A8TX70 2615 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACYP1P07311 99 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHD7Q9P2D1 2997 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFB1O75438 58 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 BPTFQ12830 3046 aa-2.97□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-2.97□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-2.97□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT1HL1P0DM35 61 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNP1P09430 55 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT1EP04732 61 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCOA2Q15596 1464 aa-3.03□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITPR1Q14643 2758 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYO9AB2RTY4 2548 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 DIP2BQ9P265 1576 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP295Q9C0D2 2601 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 C14orf144Q96I85 54 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 GYPAP02724 150 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 C20orf78Q9BR46 151 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRBAP50851 2863 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBP2P50120 134 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFA4O00483 81 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 S100PP25815 95 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 UMAD1C9J7I0 102 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP162Q5TB80 1403 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACBD7Q8N6N7 88 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 MT1LQ93083 61 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-3.13□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms