RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.81□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.81□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 FAM104AQ969W3 186 aa6.8□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 LUZP6Q538Z0 58 aa6.8□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 WIPF1O43516 503 aa6.78□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.78□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 SPRR4Q96PI1 79 aa6.78□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 COL12A1Q99715 3063 aa6.78□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.78□□□□□ -1.32
CLN8-201ENST00000331222 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.75□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 PRR34Q9NV39 138 aa6.74□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 ATMQ13315 3056 aa6.74□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 LRBAP50851 2863 aa6.74□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 CD164Q04900 197 aa6.72□□□□□ -1.33
CLN8-201ENST00000331222 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 LINC00483Q53H64 154 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PNM2 257 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.68□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 S4R3F8 94 aa6.67□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 ZZEF1O43149 2961 aa6.66□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 TACC2O95359 2948 aa6.66□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 H7BZZ5 65 aa6.66□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.66□□□□□ -1.34
CLN8-201ENST00000331222 KLK9Q2XQG4 91 aa6.63□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GU33 70 aa6.63□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 A0A096LNT2 108 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 COL6A5A8TX70 2615 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 LCA10Q71F78 164 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.61□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.61□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.61□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 Q1T7F1 81 aa6.61□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 KLKP1Q107X0 134 aa6.61□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 STAB1Q9NY15 2570 aa6.59□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 NOTCH1P46531 2555 aa6.59□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 HRES1P13985 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLN8-201ENST00000331222 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 Q5VSD8 79 aa6.57□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.56□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 R4GN34 69 aa6.55□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 ZNF292O60281 2723 aa6.55□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.54□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.54□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 CSAG1Q6PB30 78 aa6.53□□□□□ -1.36
CLN8-201ENST00000331222 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.52□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 PRAC1Q96KF2 57 aa6.52□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.51□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 LAMA5O15230 3695 aa6.5□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 SPINK7P58062 85 aa6.48□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 ITPR1Q14643 2758 aa6.47□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 OCR1Q9BZK8 76 aa6.46□□□□□ -1.37
CLN8-201ENST00000331222 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 M0QZ58 72 aa6.45□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.45□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 DMAC1Q96GE9 116 aa6.44□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 PLAC4Q8WY50 150 aa6.43□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 Q5W150 140 aa6.43□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP10-2P60368 255 aa6.42□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.41□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.41□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 Q8NDZ9 215 aa6.41□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP10-1P60331 282 aa6.4□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 RELNP78509 3460 aa6.4□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.4□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.4□□□□□ -1.38
CLN8-201ENST00000331222 ITPR2Q14571 2701 aa6.4□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.39□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 APCP25054 2843 aa6.39□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.38□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.37□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 CUBNO60494 3623 aa6.36□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.36□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 Q75L30 129 aa6.36□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 H3BS24 57 aa6.35□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.35□□□□□ -1.39
CLN8-201ENST00000331222 A0A0A0MQY5 61 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN8-201ENST00000331222 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN8-201ENST00000331222 HIVEP1P15822 2718 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN8-201ENST00000331222 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN8-201ENST00000331222 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.31□□□□□ -1.4
CLN8-201ENST00000331222 DMDP11532 3685 aa6.31□□□□□ -1.4
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