RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf90A8MZG2 172 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-3P60369 221 aa9.47□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.46□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 TENM3Q9P273 2699 aa9.46□□□□□ -0.89
CCNDBP1-201ENST00000300213 LIMD2Q9BT23 127 aa9.46□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGFL1Q6UW32 110 aa9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASC10Q5T4H9 136 aa9.44□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.43□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 REG3GQ6UW15 175 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 COA5Q86WW8 74 aa9.42□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.4□□□□□ -0.9
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCA10Q71F78 164 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR4Q96PI1 79 aa9.38□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.35□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 LCE6AA0A183 80 aa9.35□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNP2Q05952 138 aa9.34□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GW54 56 aa9.34□□□□□ -0.91
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.33□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.33□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 TENM2Q9NT68 2774 aa9.32□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.32□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.3□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.29□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK2AP2O75956 126 aa9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRAC1Q96KF2 57 aa9.27□□□□□ -0.92
CCNDBP1-201ENST00000300213 COL7A1Q02388 2944 aa9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHTF8P0CG12 524 aa9.27□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINK7P58062 85 aa9.26□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.25□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 A8MWP4 228 aa9.25□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.24□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.24□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.24□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 MOBPQ13875 183 aa9.23□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q75L30 129 aa9.23□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.23□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.23□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRR1AP35321 89 aa9.22□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.22□□□□□ -0.93
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.19□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BPC8 53 aa9.19□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.19□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 A6NN06 94 aa9.17□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.16□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.15□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.15□□□□□ -0.94
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.14□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.13□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BNG1 76 aa9.12□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 HRES1P13985 223 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00313P59037 77 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 K7EIL1 84 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 MDFIQ99750 246 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP10-11P60412 298 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.08□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.07□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.07□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.07□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.06□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf87E5RJ46 101 aa9.04□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.03□□□□□ -0.96
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GU69 56 aa9□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087X002 238 aa8.99□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.99□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANK2Q01484 3957 aa8.98□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 H3BS24 57 aa8.97□□□□□ -0.97
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GVX0 72 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINK1P00995 79 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACYP2P14621 99 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.92□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01554Q52M75 96 aa8.92□□□□□ -0.98
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q5W150 140 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 PANO1I0J062 215 aa8.88□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.86□□□□□ -0.99
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.85□□□□□ -0.99
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